Püha graali, nõud, millest Jeesus jõi viimase õhtusöömaajal, ihkavad enda kätte saada nii USA valitsus kui ka natsid. Ameeriklased pöörduvad selleks taas Indiana Jonesi poole. Indiana teab, et tema isa Henry on aastaid seda otsinud ning tema päevikus on olemas ka vihjed selle leidmiseks. Kuid põhjus, miks valitsus just noorema Jonesi poole pöördus on lihtne - natsid röövisid ta isa.

Humble stamp dealer Otto Becker has little to do with international politics, so when he receives a surprise visit from his estranged twin brother and Nazi spy, Baron Hugo von Detner, his world is thrown into turmoil. Threatening Becker with deportation, Hugo forces him to use his shop as a front for espionage.