Subaru Natsuki a basculé dans un monde fantastique où il fait la connaissance d’Émilia, une jeune fille aux longs cheveux d’argent qu’il jure de protéger. Malheureusement, le jeune homme ne résiste pas longtemps en se faisant tuer rapidement. Pourtant, il revient d’entre les morts, un phénomène qui se répète sans cesse, le ramenant toujours à son point de départ. Subaru entame alors un combat perpétuel dans lequel il essaie, peu à peu, de changer le futur...
Yukito Kunisaki est en voyage à la recherche de la jeune fille ailée qui a été liée au ciel il y a des siècles, après avoir entendu un vieux conte d'enfance de sa mère. Alors que Yukito montre son spectacle de marionnettes aux gens dans l'espoir de gagner de l'argent, il se retrouve dans une petite ville où il ne s'attend pas à rester très longtemps. Cependant, quand il rencontre une fille inhabituelle nommée Misuzu, les choses prennent un tour comme il est invité à rester avec elle.
En restant dans la ville pittoresque, Yukito devient bientôt amis avec les habitants. Au fur et à mesure qu'il apprend à mieux les connaître, il apprend de leurs problèmes et décide d'aider, mettant en attente sa recherche de Winged Maiden. Avec l'attachement à Misuzu et à la petite ville, Yukito pourra-t-il jamais trouver la Fille Ailée, ou est-ce plus proche qu'il ne le pensait?
La Brigade des anges, une branche d'élite de l'armée de l'Empire Transbaal, est chargée de rechercher The Lost Technology, des objets mystérieux du passé qui détiennent des pouvoirs inconnus. Dirigée par le Colonel Volcott O 'Huey, qui s'apprête à prendre sa retraite, la Brigade des Anges se rend sur différentes planètes à l'aide de leurs vaisseaux Emblem Frame spécialement conçus à la recherche de Lost Technology. Malheureusement, ils gâchent souvent d'une manière ou d'une autre et finissent par se retrouver dans toutes sortes de situations embarrassantes et gênantes.
Yuuichi, banal jeune homme de 17 ans, va faire ses études dans une petite ville où il était venu 7 ans plus tôt. A l'époque, il y passait ses vacances avec sa cousine Nayuki. Il ne garde néanmoins aucun souvenir précis de cette époque, que ça soit des rencontres qu'il y a fait ou des aventures qu'il y a vécu.
Un jour où il attend que Nayuki ai fini de faire ses courses, il se fait bousculer par une étrange fillette. Elle s'appelle Ayu et tous deux réalisent rapidement qu'ils étaient autrefois compagnons de jeu. Au fil de ses rencontres, Yuuichi va peu à peu retrouver la mémoire sur son passé vécu dans cette ville et découvrir des souvenirs parfois douloureux qu'il aurait certainement du oublier à jamais...
Adapté d'un eroge des mêmes auteurs que Air, Kanon 2006 est un remake d'un premier anime de 13 épisodes datant de 2002.
Dans l'Angleterre du XIX siècle, Lydia Carlton a un métier peu commun : celui de soigner les fées. En effet, Lydia est capable de les voir et de leur parler. Ce don lui attire néanmoins quelques problèmes, comme le fait qu'elle soit quelque peu rejetée par les personnes qui l'entourent.
Lors d'un voyage dans la capitale Londonnienne pour rendre visite à son père, elle fait la rencontre d'un certain Edgar J. C. Ashenberg qui la sauve d'un kidnapping. Le jeune homme dit être à la recherche d'une épée et se proclame même être un descendant du Chevalier Bleu, le Roi du Pays des fées. Ayant besoin du don de Lydia dans sa quête, celle-ci accepte de le suivre et se retrouve alors embarquée avec le jeune homme à la recherche de la relique.
L’équipe de mah-jong de l’institut pour filles Achiga à Nara arriva une fois en demi-finale du tournoi national, mais y échoua. Le club de mah-jong fut alors dissous. Six ans plus tard, la jeune Shizuno Takakamo se lie d'amitié avec Nodoka Haramura. Elles entrent toutes les deux à l’institut Achiga, mais Nodoka change d’école en cours de route. Lorsque Shizuno voit Nodoka à la télévision l'année suivante au tournoi individuel des collèges, elle décide de faire revivre le club de mah-jong d’Achiga et d’aller poursuivre son amie d’enfance aux nationales.