Tsubasa Kazanari e Kanade Amō, una famosa coppia di idol chiamata Zwei Wing, combattono segretamente una razza aliena nota come Noise usando le cosiddette armature Symphogear. Un giorno però Kanade, per proteggere una ragazza di nome Hibiki Tachibana, ferita gravemente da un Noise proprio mentre assisteva ad un concerto delle Zwei Wing, è costretta a sacrificare se stessa. Due anni dopo, mentre Tsubasa continua ad affrontare i Noise da sola, Hibiki, ora studentessa dell'Accademia privata di musica Lydian, scopre di aver ereditato involontariamente il potere di Kanade.

Bella Sway, una pilota di cargo lunare e contrabbandiera 100 anni nel futuro, si ritrova accusata di un crimine e abbandonata a Moonhaven, una comunità utopica ambientata su un Giardino dell'Eden di 500 miglia quadrate costruito sulla Luna per trovare soluzioni ai problemi che si presenteranno. presto porre fine alla civiltà sulla Madre Terra.