O sobrenaturalmente dotado jovem Touma alia-se à freira Index contra forças malignas que buscam poderosos textos mágicos implantados na mente de Index.
Mikoto usa a habilidade para controlar eletricidade para ajudar a manter a ordem na Cidade Académica, onde a maioria dos habitantes é composta por alunos com dotes místicos.
After rescuing Last Order and subsequently taking a bullet to the head, Academy City’s top-ranked esper rests in the hospital. But Accelerator’s recovery is cut short when a mysterious girl carrying a photo of his little clone companion asks for help. Now they’re taking on Disciplinary Action—an anti-evil coalition whose sinister plans threaten Last Order, Academy City, and even the entire world!