Né dans les flammes de l'enfer, le démon Hellboy est transporté sur Terre lors d'une sombre cérémonie célébrée par les nazis, désireux d'utiliser les forces infernales à des fins de conquête. Sauvé par le docteur Broom, Hellboy est alors élevé pour combattre les forces du Mal. Armé, possédant un bras droit en pierre, il fait équipe avec le télépathe Abe Sapien et Liz Sherman, capable de contrôler le feu...
Depuis plus de 10 ans, les parents Andy et Vicky sont en fuite, désespérés de cacher leur fille Charlie à une agence fédérale obscure qui veut exploiter son don sans précédent pour créer le feu en une arme de destruction massive. Andy a appris à Charlie comment désamorcer son pouvoir, qui est déclenché par la colère ou la douleur. Mais à mesure que Charlie atteint l’âge de 11 ans, le feu devient de plus en plus difficile à contrôler. Après qu’un incident a révélé l’emplacement de la famille, un mystérieux agent est déployé pour traquer la famille et saisir Charlie une fois pour toutes. Charlie a d’autres projets.