一天，宇宙开发中心的上空发现了来历不明的宇宙飞船，一名神秘女子出现，中心继而受到两只怪兽的袭击。 超人高斯及时出现，但怪兽极之顽强，高斯几乎不敌，幸得春野武藏之助，二人融为一体后始威力大增，而正当怪兽快被击退之际，另一个超人迪斯忽然出现，她竟然出手阻止高斯保护地球，最后竟令高斯及武藏死于怪兽之手。 太空船的目的到底是什么？

　　原来，神秘女子来地球竟是为了维持宇宙的秩序，而要把地球上所有生物全部消灭！ 为了自救，地球各国各尽办法，但似乎，高斯的死已是提前判了死刑。 地球即将毁于一旦，大家了无办法，除非奇迹出现... 然而，武藏的亲人和队友都坚信高斯和武藏未死，他们四出奔走，希望奇迹真的出现！

An alternate version of Ultraman Cosmos 2: The Blue Planet, which was created due to the arrest of the film's star, Taiyo Sugiura. New scenes were filmed that are primarily set in the past. Musashi Haruno, now a middle school student, continues to pursue his dream to become an astronaut, which is also a promise he made with Cosmos. However, he is on the verge of despair because space development gets canceled due to a rocket accident. A mysterious girl named Shau appears in front of Musashi. She invites him to a mysterious parallel space and shows him a vision of what will happen to him 10 years from now. He witnessed a crisis of Earth's destruction caused by Sandros, the worst destroyer in the universe!

终于达成少年时代的梦想而成为宇宙飞行员的武藏，在参加好朋友务的婚礼时，于塞班岛遇上异星人夏乌和吉恩。夏乌和吉恩的故乡，因为遭受宇宙怪兽山多洛斯的攻击而被毁灭，他们来到地球的海底世界Blue Area，希望能够研究出让故乡自然再生的方法。然而，山多洛斯却与此同时派出侵略武器史寇比斯前来地球袭击，即使连K2护盾都抵挡不住了！威胁一步一步地逼近，大家都期盼消失已久的超人高斯再次出现……

奥特曼是圆谷株式会社拍摄的科学空想特摄电视连续剧，由杂志连载、电影、电视剧变成节目演变出现。奥特曼在普通人眼中是高大的巨人，就如同神一般的存在，可是他们对于自己的种族，自己的星球来说也只不过是一个普通人。超进化给他们带来了完善的生命形态，同时也使他们背负起了沉重的历史责任，在这种历史责任感驱使下，光之巨人的足迹遍步宇宙，而其中有这么几位巨人，他们来到了我们所在的地球，懈诟了宇宙中最奇妙也是最难以捉摸的生命体―人类。