Wojna się skończyła, a Violet Evergarden potrzebuje pracy. Pozbawiona emocji bohaterka zajmuje się pisaniem listów, aby lepiej zrozumieć siebie i własną przeszłość.
"Korzystać z młodości" To właśnie postanowiła uczennica drugiej liceum, Tamaki Mari. Mimo to, za każdym razem, gdy ma zamiar zrobić coś niezwykłego, kończy się na tym, że przestraszona konsekwencji i tego, że coś może nie wyjść, dziewczyna rezygnuje. To wszystko zmienia się, gdy Mari poznaje uczennicę klasy równoległej. Kobuchizawa Shirase, bo tak nazywa się dziewczyna, za wszelką cenę chce popłynąć na Antarktykę. Dziewczyny łączą siły i zarażając swoim entuzjazmem i determinacją dwie inne koleżanki, starają się dostać do "miejsca dalszego niż wszechświat".
Osierocony 17-latek, samotnik i zawodowy gracz w shōgi, zaczyna otwierać się na świat, gdy trzy siostry biorą go pod swoje skrzydła.
Historia kręci się wokół piątki licealistów, którzy są zbyt młodzi aby nazywać ich dorosłymi, ale którzy nie są uważani za dzieci. Wakana Sekai chodziła na lekcje muzyki, ale odeszła po stracie matki. Konatsu Miyamoto jest pozytywnie myślącą dziewczyną, która kocha śpiewać i uczęszcza do chóru. Sawa Okita jest członkiem szkolnego klubu łucznictwa, ale jej marzeniem jest ujeżdżanie koni. Taichi Tanaka uczęszcza do klubu badmintona i który mieszka ze swoją siostrą, studentką. 'Wien' po prostu przeniósł się do klasy Wakany, po 12 latach spędzonych w Austrii. Wakana, Konatsu, Sawa i chłopcy zakładają nowy chór podczas ostaniego roku liceum.