30 évvel azután, hogy Dr. Sam Beckett belépett a részecskegyorsítóba és eltűnt, egy új csapatot követhetünk nyomon, akiknek újra kell indítania a projektet abban a reményben, hogy megérti a gép és alkotója mögött rejlő rejtélyeket.
Cybernetics engineer Fred Stiller uncovers a massive corporate conspiracy involving a virtual reality computer project.
Three computer-savvy kids, Naoto, Yuka and Ippei created their own videogame superhero, but then discover it possessed by an inter-dimensional police officer, Gridman. Pursuing an evil program called Kahn Digifer, he merges with Naoto and fights Kahn Digifer's digitized monsters in order to prevent the computerized demon from wreaking havoc on the Human World.