Минув 31 рік після завершення Третьої світової війни. На руїнах міста Токіо відбудовано нову столицю – Нео-Токіо. Через невдалі податкові реформи в країні починаються масові заворушення. Вулиці міста перетворюються на арену численних антиурядових демонстрацій, терористичних атак радикальних організацій та жорстоких бійок банд байкерів. Країною шириться культ Акіри, адепти якого звіщають, що саме надлюдина Акіра має врятувати Японію. Тим часом в секретних дослідницьких центрах під наглядом військових тривають експерименти над людьми з метою створення досконалої зброї.

За сюжетом, одного ранку професор астрономії Дональд Кесслер доповідає президенту США, що на навколоземній орбіті Землі знаходяться сотні «літаючих тарілок». Настільки значуща подія, як Перший Контакт, сколихнуло всю Землю, а те, що марсіани вирішили приземлитися на території США, в пустелі Невада, підняло і так чималий престиж країни. Проте зустріч з прибульцями перетворюється із свята на трагедію, адже виявилось, що марсіани прийшли на Землю зовсім не з мирними намірами…