世界聞名的怪盜魯邦三世及其搭檔次元大介，成功從摩納哥國營賭場的金庫中盜走一筆鉅款，並甩開追兵乘車逃走。兩人在車內雖然可說是被埋在鈔票堆裡，但眼尖的魯邦卻發現，這是史上製作最精巧的夢幻偽鈔「哥德鈔」。在魯邦「不偷假貨」的原則下，他將哥德鈔毫不吝惜地撒在路上，並選定了他的下一個目標就是要揭開哥德鈔的秘密。於是魯邦出發前往疑雲重重的歐洲獨立國家「卡里奧斯特羅公國」。

魯邦與次元兩人改變身份潛入卡里奧斯特羅公國，但車子卻在路上爆胎。在修輪胎時，他們發現一名身穿結婚禮服的少女被惡漢所追，於是出手擊退惡漢，救了墜崖的少女。但留下了一枚刻有哥德文字戒指的少女，卻被另一群人給帶走。之後證實，那名少女正是卡里奧斯特羅公國大公家的繼承人克蕾莉絲‧德‧卡里奧斯特羅。目前由於現任大公猝逝，由萊瑟‧德‧卡里奧斯特羅伯爵擔任攝政，留下了大公之位的空缺。

身為卡里奧斯特羅公國實質統治者的萊瑟，打算藉由娶克蕾莉絲為妻，取得大公之位，進行獨裁統治。再度成為階下囚的克蕾莉絲，被關進了萊瑟的居城卡里奧斯特羅城。魯邦為了將她救出，找來了老戰友石川五右衛門。但得知魯邦對萊瑟發下預告書的錢形警部，也率領了警官隊（埼玉縣警察局的機動隊）前來，準備逮捕魯邦。加上早已變裝為家庭教師潛入卡里奧斯特羅城的峰不二子在內，「魯邦家族」至此全數到齊了。以卡里奧斯特羅城為舞台，為了救出克蕾莉絲與揭開哥德鈔之謎，展開了一場大混戰。