Ein halbes Jahr ist seit der Beendigung des Konfliktes rund um Fate und dem Beginn der innigen Freundschaft zwischen ihr und Nanoha vergangen. Um Fate ein möglichst normales Leben zu ermöglichen zieht ihre neue Adoptivmutter Lindy mit Fate und Arf auf die Erde, wo Fate nun die gleiche Klasse wie Nanoha besucht. Doch die Freude über ihre Wiedervereinigung währt nur kurz, denn schon kurz darauf werden die Wolkenritter in der Stadt gesichtet, eine Gruppe von magischen Rittern, welche dem »Buch der Finsternis« entstammen und dessen Seiten durch das Absorbieren magischer Kräfte zu füllen trachten, um so ihrem Meister zu großer Macht zu verhelfen.

半年前的一连串遭遇，彻底改变了三年级小学生高町奈叶（田村由香里 配音）的人生，她以魔法少女的身份邂逅了可爱的小伙伴尤诺·斯克莱亚（水桥香织 饰），并通过连番激战与深锁着无数秘密和烦恼的菲特·泰斯特罗莎（水树奈奈 配音）成为莫逆好友。新学期开始，菲特以小学生的身份转入奈叶的班级，一切看似进入了平稳期。克就在某个毫无征兆的夜晚，奈叶和菲特遭到手持暗之书的维塔（真田麻美 配音）等三名违法渡行者的袭击，她们的魔导器也被破坏。 新的危机，新的对手，一切朝着不可预知的方向发展……

마법소녀 리리컬 나노하 시리즈의 두 번째 극장판. TV판 2기 마법소녀 리리컬 나노하 A's를 원작으로 한다.

Han pasado seis meses desde los acontecimientos de la película anterior. El destino ha regresado a la ciudad de Uminari con Lindy como su tutor legal y está viviendo la vida de una niña normal de primaria junto con Nanoha y sus amigos. Sin embargo, la reunión entre los dos nuevos amigos se interrumpe cuando son atacados por cuatro antiguos usuarios de magia que se identifican como Wolkenritter. A medida que los motivos detrás de las acciones de Wolkenritter se vuelven claros, Nanoha y Fate se encuentran en una carrera contra el tiempo para detener la reactivación de un artefacto altamente peligroso conocido como El Libro de la Oscuridad.

Le nouveau film de la franchise "Magical Girl Lyrical Nanoha" reprend à travers ce film, comme "Magical Girl Lyrical Nanoha The Movie 1st" le faisait avec la première saison, les événements de la seconde "Magical Girl Lyrical Nanoha A's". Quelques mois à peine ce sont écoulés depuis les événements de l'affaire Testarossa, Nanoha et Fate, désormais amies, travaillant toutes deux désormais pour le Bureau d'Administration de l'Espace et du Temps, se retrouvent confronté à une nouvelle menace... Cette fois-ci, c'est du Livre des Ténèbres, une puissante relique capable de capturer la puissance des magiciens et dont le réveil serait terrible dont il est question. Nanoha et Fate se lancent donc avec le Bureau dans une enquête pour empêcher ce désastre mais se heurtent violemment contre les Gardiens du Livre des Ténèbres... Les Wolkenritters...

Zes maanden zijn verstreken sinds de gebeurtenissen van de vorige film. Fate Testarossa is teruggekeerd naar Uminari City, samen met Lindy Harlaown, haar voogd en leeft het leven van een normaal basisschool meisje samen met Nanoha Takamachi en haar vrienden. Het weerzien tussen de twee nieuwe vrienden wordt echter abrupt onderbroken, wanneer ze worden aangevallen door vier oude magische gebruikers die zichzelf als de "Wolkenritter" identificeren. Als de motieven achter de acties van de Wolkenritter duidelijker worden, bevinden Nanoha en Fate zich in een race tegen de klok om de heractivering van een zeer gevaarlijk artefact bekend als "The Book of Darkness" te stoppen.

Six months after the events of Magical Girl Lyrical Nanoha: The Movie 1st, Fate has returned to Uminari City with Lindy as her legal guardian and is living the life of a normal elementary schoolgirl along with Nanoha and her friends. The reunion between the two new-found friends is cut short, however, when they are assaulted by four ancient magic users who identify themselves as the Wolkenritter. As the motives behind the actions of the Wolkenritter become clear, Nanoha and Fate find themselves in a race against time to stop the reactivation of a highly dangerous artifact known as the Book of Darkness.

Sei mesi dopo gli eventi di Magical Girl Lyrical Nanoha: The Movie 1st, Fate è tornata a Uminari City con Lindy come sua tutrice legale e sta vivendo la vita di una normale studentessa elementare insieme a Nanoha e ai suoi amici. La riunione tra i due ritrovati amici è interrotta, tuttavia, quando vengono assaliti da quattro antichi utenti magici che si identificano come i Wolkenritter. Mentre i motivi dietro le azioni dei Wolkenritter diventano chiari, Nanoha e Fate si trovano in una corsa contro il tempo per fermare la riattivazione di un artefatto altamente pericoloso noto come il Libro delle Tenebre.

ある夜、八神はやてはトラックとの事故に遭ってしまうが、「闇の書」が起動することによって助かる。そして「守護騎士（ヴォルケンリッター）」と出会い、闇の書の主となる。はやてと触れ合う内、いつしか家族のような絆で結ばれるヴォルケンリッターであったが、闇の書の呪いによりはやての余命があとわずかであることを知った彼女達ははやてを救うため、はやてに禁じられた闇の書の蒐集を開始する。 ロストロギア「ジュエルシード」が発端となったプレシア・テスタロッサ事件から半年後、裁判が終わったフェイトとなのはの再会が果たされた。しかしその夜、ヴォルケンリッターの襲撃にあい敗北し、なのは達はリンカーコアを闇の書に蒐集されてしまう。 この闇の書の起動によって引き起こされる数多くの痛み・悲しみを終わらせるため、そして、大切な主であるはやてを救うため、戦うヴォルケンリッター、真相を知らず彼女達と対立するなのはとフェイトら時空管理局一同。二つの思いがぶつかる中、事件は思いがけない方向へと向かう。はたして、ヴォルケンリッターははやてを救うことができるのか？そして、なのはとフェイト達は闇の書の呪いを断ち切ることができるのか？

Sześć miesięcy po wydarzeniach z Magiczna dziewczyna, Liryczna Nanoha: Film 1, Fate powróciła do Uminari City z Lindy jako jej prawnym opiekunem i prowadzi życie normalnej uczennicy szkoły podstawowej wraz z Nanohą i jej przyjaciółmi. Ponowne spotkanie między dwiema świeżo upieczonymi przyjaciółkami zostaje jednak przerwane, kiedy zostają one zaatakowane przez czwórkę starożytnych magów, czyli tzw. Wolkenritterów. Kiedy motywy stojące za ich działaniami stają się jasne, Nanoha i Fate znajdują się w wyścigu z czasem, aby powstrzymać reaktywację bardzo niebezpiecznego artefaktu znanego jako Księga Ciemności.

Muitos meses depois de Nanoha se tornar uma Garota Mágica, ela ainda é incapaz de se encontrar pessoalmente com sua nova melhor amiga, Fate Testarossa, que está na Administração do Espaço/Tempo , pela sua associação com o caso da Lost Logia. Eles ainda se comunicam por video-email e esperam ver uma a outra novamente. O encontro delas, não é muito feliz, pois infelizmente, um bando de pessoas que denominam-se "Velka-Type Knights" lutam contra Nanoha. O objetivo delas é preencher as páginas dos Livros das Trevas roubando o poder mágico de qualquer um que consiga encontrá-lo. Nanoha e Fate deverão se unir mais uma vez para interromper os planos deles e salvar o mundo. Continuação do filme Mahou Shoujo Lyrical Nanoha.

Действие фильма происходит через 6 месяцев после предыдущего. Фейт Тестаросса возвращается в Uminari City с Линди, как со своим опекуном, и живет обычной жизнью девочки-младшеклассницы вместе с Нанохой Такамати и ее друзьями. Но воссоединение друзей длится недолго, потому что на них нападают четверо, использующие древнюю магию и зовущие себя Wolkenritter (нем. Облачные Рыцари). К тому моменту, как их мотивы проясняются, Наноха и Фейт спешат остановить пробуждение артефакта, названного "Книгой Тьмы".