Тази трета и последна част на историята за странстващия самурай Химура Кеншин, следва събитията от предишния филм - Rurouni Kenshin: Kyoto Inferno, в който след сблъсък със злодея Макото Шишио, Кеншин скача в морето. Събуждайки се, той се озовава лице в лице със своя ментор и учител Сейджуро Хико.

Осъзнавайки, че не е в състояние да победи Шишио, Кеншин се опитва да убеди учителя си да му предаде последната техника на стила Хитен Мицуруги Рю, за да пребори злото веднъж и завинаги...