小智一行人抵達了小光預備參加寶可夢華麗大賽的白楊鎮，在那裡他們認識了駕駛熱氣球的女子艾莉絲、其青梅竹馬東尼歐，以及艾伯特男爵。由於艾伯特男爵認定隱居於城鎮庭園中的黑暗寶可夢-達克萊伊是近日來破壞城鎮的元兇，並準備討伐牠。 然而東尼歐的想法卻不同，他偵測到在白楊鎮的上方有一股異常的衝擊波，而那正是傳說中分別掌控時間的帝牙盧卡與空間的帕路奇犽這兩大傳說中的寶可夢在次元夾縫中大戰所造成；而達克萊伊的攻擊正是為了讓牠們遠離這座城鎮。隨著兩大傳說中的寶可夢的爭鬥越來越激烈，終於在白楊鎮的名景「時空之塔」的上方產生了空間裂縫，戰場也隨之轉移到了白楊鎮。小智他們該如何阻止這場危機？而眾人對達克萊伊的誤解又會如何化解？好看又刺激的一場爭鬥即將展開!