出生於2105年的迪娜是ESWAT人類強化名單的第一順位的人類戰士，與布裡艾諾斯是一對戀人。她的父親為傳說中的戰士，父親則是“奧林帕斯”的創始者之一吉莉亞姆博士，掌握著APPLE SEED－生化人繁殖基因的關鍵。而布裡艾諾斯則在戰爭時受過重傷，被七賢老所救且全身被改造成機械化，現擔任奧林帕斯的維安部隊－ESWAT的一員，由於改造人的身分而不得不壓抑自己對迪娜的愛。 迪娜在戰爭結束後，由布裡艾諾斯以及神秘女子·瞳所引領，來到了和平都市“奧林帕斯”。“奧林帕斯”是個由不具備攻擊性、且無繁殖能力的優良品種生化人與人類共存的都市。可是就在大家期待這兒成為新的烏托邦時，人類與生化人的對立卻日漸激烈，最後連迪娜與布裡艾諾斯都被卷入這場為了爭奪“APPLESEED”的爭鬥之中。