當麻（戶田惠梨香 飾）與瀨文（加瀨亮 飾）等人聚在總部，苦苦思索著下一步，而外面殘忍屠戮案件四起。看著四周一片悲慘與渾沌，憤怒的當麻再也無法抑制體內被封印的SPEC。她狂亂現身於「御前會議」，於此同時災難相繼在各地爆發，法蒂瑪第三預言不可避免地實現了。瀨文、當麻以及他們的夥伴，成為左右歷史走向的關鍵人物。這一場戰爭究竟是時代的結局，抑或是新的開始…？