Scramble City speelt zich af na het tweede seizoen van Transformers en is een verhaal waarin de Cybertrons een geheim laboratorium hebben gebouwd, verborgen in een berg, om een ​​nieuwe superrobot te bouwen, Metroplex, die als mobiele basis voor hen zal dienen. Terwijl Ultra Magnus het voorbereidt, ontdekken de Destrons de locatie en vallen het aan. De Cybertron- en Destron-teams vechten het uit over de berg, waarna Metroplex naar buiten komt en alle Destrons verslaat, maar dan komt Typticon uit het water! Kan Metroplex Trypticon verslaan???