邪惡的電腦生命體－星雲灰(Nebula Gray)在「電腦世界」中開端行動。世界各地發作許多非物質化現象，「理想世界」因而不時消滅。當星雲灰(Nebula Gray)進化成完整體時，「理想世界」和「電腦世界」將會逆轉。地球將會被消滅而轉變為宏大的電腦空間。 守護世界戰爭的網路救世主(Net Savior)－光熱斗，與他的夥伴網路領航員－洛克人一同前往毁壞星雲灰(Nebula Gray)。但是最強的網路領航員佛魯迪……卻擋住他們的去路。此外，敵我不明的神秘網路領航員卡尼爾也呈現。 為了阻止世界的消滅，洛克人史上最大的網路對戰，現在開始...