« Ici, je vais me transcender ! » Un anonyme de 34 ans, célibataire endurci, reclus et au chômage se fait écraser par un camion peu après avoir été chassé de la maison familiale. Quelle ne fut pas sa surprise lorsqu'il se réveilla bébé dans un monde d'épées et de magie ! Rudeus, comme il s'appelait désormais, jura alors de réussir sa deuxième vie et de tirer un trait sur l'immonde déchet qu'il avait été 34 ans durant. Dès son jeune âge, il nouera de nombreux liens dans ce nouveau monde, notamment une solide amitié avec trois fillettes, avant de partir pour une aventure aussi palpitante que périlleuse. Une seconde chance lui a été accordée… et elle ne sera pas de tout repos !

Il y a 12 000 ans, une guerre commence et oppose les anges déchus d'Atlantis, gardiens de l'Arbre de vie, aux humains. Pendant cette bataille, un ange déchu nommé Appolonius et surnommé aussi "Les Ailes du Soleil" avait trahi les siens pour l'amour d'une humaine, Siren. Pour protéger les humains, il prit les commandes d'un mecha, nommé Aquarion, et remporta la bataille. Cependant, longtemps après cette bataille, le conflit se reproduisit. Afin d'assurer la sécurité de l'humanité, un groupe de protection lutte contre les invasions répétées des anges déchus, qui s'emparent de l'énergie vitale des humains, pour nourrir leur Arbre de vie. Grâce aux vectors, un type d'Aquarion peut être alors crée (Solar, Luna, ou Mars) et contrôlé par des pilotes possédant des pouvoirs particuliers. Mais qui sont réellement ces pilotes ?

Dans le beau pays d'Astraea, le jeune Yûki se réveille sans avoir aucun souvenir de son passé. Il rencontre toutefois Kokkoro (une guide ayant juré de prendre soin de lui), Pecorine (une charmante épéiste ayant toujours un petit creux) et enfin Karyl (une sorcière aux oreilles de chat au caractère épineux). Se laissant porter par leur destin, tous les quatre se rassemblent pour former la Guilde des Gourmets.

Six mois après la conclusion de la campagne L5 et la guerre de DC, les équipages des transporteurs PT, Hagane et Hiryuu sont allés chacun de leur côté. Ils ne sont pas éloignées pour longtemps... Les rescapés du DC commencent pousser contre les forces de la Fédération de ressources, nouvellement acquises. Une mystérieuse organisation, le Miroir d'ombres, a commencé à les armer avec des armes et des robots qui ne devraient pas exister...

Le lycée Kitauji avait un club de musique de haut niveau, mais il est tombé en désuétude quand son responsable est parti. En attendant, avec ses camarades de classe Hazuki et Sapphire, Kumiko Ômae vient observer un club de fanfare. Kumiko joue de l'euphonium et elle se laisserait bien entraîner dans cette aventure, mais quand elle croise Reina, une ancienne camarade de classe, elle hésite. Un incident avec Reina, durant un concours de musique, est resté gravé dans ses souvenirs…

Dans un futur proche, une scientifique japonaise a élaboré un exosquelette de combat appelé « Infinite Stratos » (IS). Possédant une technologie et des capacités de combat beaucoup plus avancées que tout autre système d'arme, l’IS menace de déstabiliser le monde. Face à une arme aussi irrésistible, les nations du monde adoptent le « traité de l'Alaska », qui stipule que l’IS ne sera jamais utilisée pour le combat militaire et que la technologie existante IS doit être également répartie entre toutes les nations, pour éviter qu’une nation puisse dominer les autres. L'introduction de l'IS a cependant un effet majeur sur la société. Comme l’IS ne peut être exploitée que par des femmes, l'équilibre du pouvoir entre hommes et femmes est brisé, les femmes venant à dominer la société.

Dix ans après que le premier IS eut été introduit, le monde est entré dans une nouvelle ère de paix. La paix est fragilisée, cependant, par une découverte inattendue. Un garçon japonais de 15 ans, nommé Ichika Orimura, se révèle être capable de faire fonctionner un IS. Réalisant son potentiel, Ichika est forcé par le gouvernement japonais d’entrer à la prestigieuse Académie Infinite Stratos, une académie internationale où sont formés les pilotes du monde entier. Ainsi commence sa vie scolaire entouré de filles.

Le lycée Hachimitsu est réputé pour être un des plus sévères du pays. Jusqu’à cette année, il était réservé aux filles, mais les garçons y sont désormais autorisés. Seulement, comme c’est l’année-test, ils ne sont que cinq dans tout l’établissement ! Kiyoshi est l’un d’eux. Il est particulièrement timide mais cherche à discuter avec des filles. Dès le premier jour, il fait connaissance avec Chiyo car la jeune fille est amatrice de sumo, tout comme lui. Mais à peine ont-ils lié amitié que ses quatre camarades garçons décident d’aller espionner les filles aux bains ! Kiyoshi acceptera-il de les accompagner, au risque de perdre la confiance de son amie ?

Le père de Momozono Nanami est dépendant des jeux d'argent et se moque d'avoir des dettes. Seulement, après avoir perdu tout l'argent de la famille, les conditions de vie deviennent très difficiles. Son père décide de fuir la maison et laisse sa fille, Nanami, sous les dettes. Ne pouvant plus payer le loyer, elle est expulsée de son appartement et se retrouve à errer dans les rues. Mais sa rencontre avec un jeune homme étrange qui l'embrasse sur le front va bouleverser entièrement sa vie d'adolescente.

En raison de sa santé précaire, Kôichi Sasakibara est contraint de quitter la capitale pour la province de Yomiyama. Intégrant la troisième 3, il est loin de se douter que sa rencontre avec Mei Misaki, une mystérieuse jeune fille ignorée par ses camarades, marque dès lors l’avènement d’une série de catastrophes macabres révélant l’existence d’une ancienne malédiction…

Les Neuroi sont apparus en 1939 et ont entamé une invasion de l'Europe. Face à cet ennemi, les forces alliés créèrent les Strike Witches, des sorcières pouvant voler grâce à une unité striker, une machine volante fixée à leurs jambes. Ce sont les derniers espoirs de l'humanité.

Nanami Takahashi arrive pour son premier jour au lycée. Ne connaissant personne, elle décide de se faire au plus vite de nouvelles amies. Pour cela, elle participe aux discussions qui se centrent toutes autour d'un jeune homme, Yano Motoharu. Elève doué, beau, souriant... Toutes les filles semblent folles amoureuses de lui. Ce qui n'est pas le cas de Nanami. Cependant, elle va apprendre peu à peu à le connaître, et va finir par être séduite à son tour par sa gentillesse et sa délicatesse. Mais Nanami découvrira que, derrière les sourires de Yano, se cache un douloureux passé.

Ushio découvre un jour dans son sous-sol un monstre, celui là même qui a été « empalé » par l’un de ses ancêtres il y a 500 ans avec la Lance du Fauve ! Ushio, qui n’avait jamais cru à cette histoire, constate que cette découverte va poser problème car le monstre va libérer des énergies négatives qui vont faire apparaître des spectres qui s’attaquent à tout le monde ! Ushio n’a plus le choix, il est obligé de libérer ce monstre mangeur d’hommes, afin de l’aider à ramener l’ordre !

Mamori Tokonome est une jeune fille qui se retrouve, contre son gré, sur une île appelée Mermaid où doivent vivre les filles touchées par le Armed Virus. Ce virus leur donne la capacité de voir se transformer en une arme à l'aide d'une partenaire qui doit se charger de produire une certaine excitation chez sa camarade.

Ainsi, Mamori est attaquée par deux jeunes filles, dès son arrivée, et ne sait absolument pas comment se défendre. C'est à ce moment qu'une autre jeune fille va arriver sur l'île et va décider de la protéger en devenant sa partenaire. Mamori va ainsi devenir la partenaire de Mirei et toutes deux vont essayer de trouver un moyen de quitter cette île avec d'autres filles qu'elles rencontrent au fur et à mesure de leur aventure.

Hikari est une jeune fille toujours pleine d'énergie, qui s'apprête à rentrer en seconde, mais qui a aussi une grande passion : la plongée sous-marine ! Elle aide d'ailleurs sa grand-mère en tant que monitrice pour accompagner les plongeurs souhaitant découvrir les fonds marins alentours. Hikari profite du dernier jour des vacances scolaires pour plonger encore une fois avant son entrée au lycée. Pendant qu'elle est sous l'eau, Futaba, une jeune fille de son âge qui vient d'arriver dans la ville rencontre la grand-mère de la plongeuse. Celle-ci montre la beauté de l'océan à Futaba, qui est fascinée. Le lendemain, les deux jeunes filles se retrouvent par hasard dans la même classe ! Hikari tentera donc d'initier Futaba à ce sport qu'est la plongée, avec l'aide d'une personne inattendue...

En 1986, Kinzô Ushiromiya, à la tête de la famille Ushiromiya, étant mourant, décide d'inviter les onze membres de sa famille à se rendre sur l'île privée de Rokkenjima afin de se décider sur le déroulement de son héritage.

Sur cette île se trouve également cinq serviteurs, ainsi que le physicien de M. Ushiromiya. Cependant, une soudaine tempête empêchera les personnes présentes sur l'île de partir. Peu après, les personnages commencent à disparaître mystérieusement.

Yamada, jeune étudiante de 15 ans a un rêve : faire l'amour avec 100 garçons lorsqu'elle sera à l'université. Seulement voilà, elle est encore vierge et ceci la dérange, suffisemment pour essayer de trouver le premier venu qui pourrait lui régler cet épineux problème. Ce fardeau tombe sur un camarade de classe : Takashi Kosuda, un garçon tout ce qu'il y a de plus normal si ce n'est que lui aussi est puceau. La belle va donc tenter de séduire par n'importe qu'elle moyen afin de le mettre dans son lit, ce qui va vite devenir une obsession.

Dans la ville de Velours, à la périphérie de Tokyo, se trouve une rue appelée « la voie du velours ». De nombreuses troupes de théâtre y sont basées, ce qui en fait la mecque des comédiens. Izumi Tachibana reçoit une lettre qui la mène à la compagnie Mankai. C’est alors qu’elle apprend que c’est son père qui l’a fondée. Cependant, ce dernier reste introuvable. En prime, elle apprend également que la compagnie n’a aucun client, qu’elle est endettée et qu’elle ne compte qu’un seul membre. Afin de remettre sur pieds cette troupe, Izumi persévère et se hisse à la tête de la direction et de la gérance du théâtre. Qu’adviendra-t-il de la compagnie Mankai ?

Shûichi Kagaya est un jeune garçon qui possède le pénible pouvoir de se transformer en mascotte. Un jour, il fait la rencontre d’une mystérieuse fille, Claire, qui semble être attirée par son pouvoir. Depuis, le quotidien de Shûichi se retrouve rythmé par d’étranges incidents… Jusqu’au jour où il se fait attaquer par un monstre possédant le même pouvoir de transformation ! Impliqués malgré eux dans un affrontement entre monstres, les deux lycéens s’unissent pour ne faire qu’un et prendre leur destin en main !

En quête de nouveaux horizons, Nina Iseri quitte sa ville natale pour poursuivre ses rêves à Tokyo. Dans l’effervescence de la métropole japonaise, elle croise le chemin de quatre jeunes femmes : Momoka Kawaragi, Tomo Ebizuka, Subaru Awa et Rupa. Si ces dernières se montrent dans un premier temps réticentes à créer des liens, leur passion commune pour la musique les conduit à fonder le groupe « Togenashi Togeari », amorçant dès lors une épopée qui s’annonce inoubliable…

Réunis par une mystérieuse chanson, une étudiante et un ingénieur combattent une force extraordinaire qui pourrait bien détruire le monde.