むじなカンパニーの社長「六科なじむ」は、ごく普通の5歳児！ 社長に甘すぎる敏腕秘書「ユキ」に、国籍不明の謎の事務員「ガルシア」、ツッコミ役の平社員「真友」といった個性的な社員たちと共に世間の荒波に突っ込んでいく！？

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５歳だけど「むじなカンパニー」の社長を務める六科なじむ。秘書の軽井沢ユキをはじめ、割戸真友、出稼ぎガルシアなど……みんなで楽しく仕事をしていた。そんなある日、「きつね商事」から武堂吉音が出向してくる。なじむたちは温かく迎えようとするのだが……。

現代社会においてとても重要なコンプライアンス。マユたちを集めて研修会を行うなじむは、自ら「ダメ社員」を演じる。「事務員の山田さん」「新入社員の毒蛸丸さん」のコンプラ違反とは！？ それを見抜く極意は……見た目に騙されないこと！

なじむとマユはキッチンカーでサンドイッチ屋をはじめるが、ユキ考案の「パンサンド」もマユ考案の「無難サンド」も全く売れず。困っていたところにガルシアが登場しオフィス街で売れるメニューを考案！ その匂いに誘われてお客さんが殺到するが……。

会社のエアコンが壊れてしまったため、暑くて仕事にならないマユたち。そんな状況を目の当たりにしたなじむは、うまく涼を取り入れたクールビズにトライ！ エアコンが効かなくても、生き生きと仕事をするマユたち……。業務内容も変更！？

ある日のこと。マユはガルシアに、入社したキッカケを聞いてみることにした。ガルシアの口から語られたのは「ワニガツナイダ絆ネ」だった。マユは、自分と同じように「ワニ」が入社のキッカケだったことを知り、あることを思い出す。

「むじなカンパニー」のＣＭオーディションに参加する岡野ＲＡＵ。マユの前では礼儀正しくするも、控室にいたのが社長のなじむだと知らずに横柄な態度をとってしまう。／なじむが社長だと知ったＲＡＵは気絶。その後、気を取り直してオーディションを再会するが、そこに用意されていたＣＭのセットに再び驚愕する。

美食家である浜岡は、最近評判の「むじな寿司」を訪れていた。板前が女児であることに驚きつつも席に着くと、目の前にはハンバーグマヨの握りが……。寿司を侮辱していると席を立つ浜岡だが、なじむから投げかけられた言葉に、大切なことを思い出すのだった。

仕事も長続きせず、安月給で生活している男は、出ていってしまった妻と娘を想いながらも公園のベンチで飲んだくれていた。すると、どこからともなく「パパ～」という可愛い女の子の声が……。そこには全力でおままごとをするなじむの姿があった。

深夜、誰もおらず静まり返る「むじなカンパニー」。そんな静寂を破ったのは窓ガラスが割れる音だった。会社の金庫を狙って侵入した泥棒だったが、そこにあったものとは……。／なじむのために「たぬザベス」の着ぐるみを作ったガルシア。マユが期待に胸を膨らませるなか登場したたぬザベスだが、そのクオリティの低さに困惑する。

岡野ＲＡＵは「むじなカンパニー」提供の番組に出演。寝起きドッキリをしかけるリポーターとなって大人気女優の子野比座梨香の部屋へ。いざ起こそうとするも、梨香は布団にくるまってしまう。ＲＡＵはフリだと思って布団に手を伸ばすが……

ある日のこと、なじむとユキは、マユを部長に任命するかどうかの話し合いをしていた。偶然そこを本人が通りかかり、立ち聞きしてしまう。ユキは経験不足を懸念するが、なじむはマユの素晴らしさを語り、部長にすることを決めるのだった。

対戦相手もラスベガスへ行くために助っ人外国人を投入する本気っぷり。しかし、そこはなじむたち！ むじなカンパニーはベガス行きの切符を手に入れることはできるのか？