각각의 도시가 독립된 생활권 클러스터가 된 미래. 그중 하나인 오차노미즈 대학원 도시의 학생 에쿠아의 진짜 정체는 탈출업자였다. 그녀에게 다른 클러스터로 탈출하고자 하는 사람들의 의뢰가 왔고, 의뢰인은 놀랍게도 그녀가 다니는 학교의 교사였는데.

신주쿠의 아쿠자 거리. 3대 야쿠자 조직 중 하나인 간토 8주 연합의 두목 토이치로부터 신주쿠에서 도망치고 싶다는 의뢰가 왔다. 그 이유에 탈출업자의 일원이자 신주쿠 출신인 펠레스가 경악했는데.

동서로 분단된 이케부쿠로의 펭인 거리. 동쪽에 소속된 수중 발레단 인원들이, 표현의 자유를 찾고자 에쿠아 일행에게 탈출하고 싶다고 의뢰했다. 하지만, 작전 도중에 에쿠아가 붙잡히고 말았는데.

탈출업자로서 작전에 임하던 중 그만 사고로 몸이 두 개로 나뉘어버린 마르테스. 하지만 그런 상황에서도 '그녀들'의 머릿속에서는 어떻게 해서 에쿠아를 독차지할 것인가에 대한 욕망이 소용돌이쳤다. 그 결과 그녀들의 머릿속에서는 한바탕 회의가 벌어졌는데.

클러스터를 관리하는 모더레이터의 가르침으로 인해 팬티를 입는 것을 꺼리고, 항상 팬티를 입지 않고 지내는 오다이바 온천지의 주민들. 하지만, 그들에게 가르침을 설파하는 신관 비발디는 팬티를 입고 싶다는 유혹에 져 에쿠아 일행에게 탈출을 의뢰했는데.

에쿠아가 감기로 앓아 눕고 말았다. 리더 없이 아키하바라에서 하치로를 탈출시키게 된 탈출업자들. 극도로 우유부단한 성격의 의뢰인은 무엇 하나 스스로 결정을 내리지 못했는데.

탈출업자 일이 없는 어느 날. 파리를 날리는 카페 보스토크를 걱정한 마르테스는 에쿠아와 펠레스에게 가게 메이크오버를 제안했다. 한편, 지하 창고에서는 알가와 울루라가 돈이 될만한 것을 찾고 있었는데.

사람들이 풍요로운 마음으로 살 수 있는 도시로 설계된 시로카네 클러스터. 하지만, 언제부터인가 인구 감소가 이어져 이제는 두 사람밖에 남지 않게 되었다. 의뢰인은 그중 한 사람인 늙은 집사로, 그가 탈출하면 다른 한 명인 어린 어리광쟁이 아가씨가 홀로 남겨지는 상황이었는데.

클러스터 자체가 감옥인 후츄 프리즌. 이곳에서 모더레이터인 소장이 휘두르는 폭력과 공포에 의해 수감자들은 부당하게 지배받고 있었다. 그런 가운데 에쿠아 일행에게 도착한 의뢰는 수감자 전원을 탈출시켜달라는 것이었고, 이를 위해 탈출업자 멤버들은 후츄 프리즌에 잠입했는데.

어느 날, 에쿠아가 능력을 쓸 수 없게 되었다. 지금까지는 없던 일에 모두가 동요한 가운데, 카페 보스토크가 감찰관 드론들에게 습격을 당하고 말았다. 탈출업자들은 아슬아슬하게 도망쳤지만, 그런 가운데 오차노미즈 클러스터 업데이트가 이루어진다고 공지가 내려왔다. 그 내용은 '탈출업자 단속 강화'였는데.

모든 클러스터에서 쫓기게 되어 갈 곳이 없어진 에쿠아와 탈출업자 일행들. 뾰족한 수가 없었던 그들은 지금까지 탈출 의뢰를 해온 M이자 세계의 관리자인 매니저에게 의지하게 되었다. 하지만 매니저와 연락을 취하기 위한 단말기가 산겐자야 마법 도시에밖에 없었고, 그런 그들을 구해준 아주 의외의 인물이 있었는데.