Nadaný, ale znuděný středoškolský student Light Yagami znenadání získá moc nad životem a smrtí.

Na celém světě dál umírají zločinci. L přes počítač navazuje spojení s představiteli různých zemí.

Light – teď všude známý jako Kira – otestuje Zápisník smrti, aby pochopil, jakou má moc. Zabije šest trestanců šesti různými způsoby.

Soichiro Yagami požaduje osobní setkání s L. Pak zjistí, že L potají přivezl do Japonska agenty FBI.

Light na policii potká ženu, která má naléhavé sdělení pro operační skupinu, která Kiru vyšetřuje.

Light použije Zápisník smrti, aby se zbavil ženy, která by ho mohla dostat za mříže. Když to nezafunguje, je v šoku.

L trvá na instalaci štěnic a kamer v domácnosti policejního velitele Yagamiho a náměstka Kitamury.

Vraždy pokračují a L začíná být podezřelé Lightovo až moc vzorné chování. Rozhodne se ho tedy vyšetřovat na vlastní pěst.

Podezření, které má L ohledně Lighta, se pořád prohlubuje. Proto se ho rozhodne přizvat k vyšetřování.

Zpravodajci a komentátoři, kteří o Kirovi vyjádřili pochybnosti, jeden po druhém umírají. Přesně jak předpověděly pásky odeslané do Sakura TV.

Když se objeví druhý Kira, L požádá Lighta, aby se přidal k operační skupině, vydával se za skutečného Kiru a pomohl chytit napodobitele.

Light cestuje do Aoyamy, aby odhalil identitu druhého Kira, než L získá ještě větší podezření.

Light a Misa si navzájem ukážou svoje Zápisníky smrti. Light požádá Misu, aby pomocí svého shinigami Rema odstranila L.

Objeví se důkazy, že druhý Kira je Misa Amane.

Misa jde do vězení, i když všechny její vzpomínky na Zápisník smrti se vymazaly.

Po padesáti dnech strávených ve vězení vraždy zase začnou a Misa s Lightem jsou propuštění na svobodu.

I když L má pořád jisté podezření, Light a Misa se vracejí na ústředí s vymazanými vzpomínkami na to, že byli Kira.

Matsuda, člen operační skupiny pověřený sledováním Misy, se chce zavděčit.

Tým pod vedením L zjistí, že skupina Yotsuba se tajně schází, aby projednávala likvidaci lidí, kteří firmě dělají potíže.

Skupina Yotsuba najme Eralda Coila, aby zjistil, kdo je L.

Mise se podaří zúžit okruh osob ze skupiny Yotsuba podezřelých z toho, že jsou Kira, na jediného člověka: Higuchiho.

Higuchi ze skupiny Yotsuba se pokusí zabít Matsudu z operační skupiny a dost ho překvapí, když po 40 sekundách nezemře.

Higuchi je dopaden a řekne vyšetřovatelům o Zápisníku smrti.

Light, kterému se vrátila paměť, přikáže Mise, aby po Higuchiho smrti začala zabíjet.

Light odstranil všechny, kdo mu stáli v cestě, a svůj dokonalý svět má na dosah ruky.

Objeví se nový vyšetřovatel Near. Near je ústřední postavou SPK, což je organizace, která se snaží Kiru dopadnout nezávisle na L.

Light se vydává za L. Nearovi namluví, že jeho sestra Sayu byla unesena někým, kdo ji chce vyměnit za Zápisník smrti.

Light se pokusí zjistit, kde se skrývá Mello se svými mafiány. Pomocí Misiných očí najde současného majitele Zápisníku smrti.

Mello vtrhne do ústředí SPK, aby získal svoji fotografii. Chce mít jistotu, že ho Kira nezabije.

Near kontaktuje japonskou operační skupinu. Je si jistý, že Kira je jejím členem.

Světovou mluvčí Kira se stává hvězdná moderátorka Kiyomi Takada.

Light předstírá, že Kiyomi vyšetřuje.

Aizawa zjistí, co se děje, a řekne to Nearovi. Ten o zápisnících už ví.

Light přikáže Kiyomi, aby se zbavila Neara.

Near doprovázený SPK se s Lightem a operační skupinou setkává ve skladišti, kde se má odehrát rozhodující souboj.

I když Mikami napsal jména všech vyšetřovatelů do Zápisníku smrti, minuta už uplynula a všichni jsou pořád naživu.