Season 0 of 神盾局特工 premiered on August 25, 2013.

Season 1 of 神盾局特工 premiered on September 24, 2013.

复仇者联盟以及随后影响深远的纽约之战，让外星人和超能力者不再是坊间传说的秘密。纽约之战过后，世界格局即将重新洗牌，野心家们蠢蠢欲动，神盾局面临前所未有的挑战。在此危急关头，一度传闻死于纽约的特工菲尔·科尔森探员（克拉克·格雷格 Clark Gregg 饰）“复活”，吸纳了身怀绝技的格兰特•沃德（布雷特·道顿 Brett Dalton 饰）、梅琳达·梅（温明娜 Ming-Na Wen 饰）、莱奥·菲兹（伊恩·德·卡兹泰克 Iain De Caestecker 饰）、盖玛·西蒙斯（伊丽莎白·亨斯屈奇 Elizabeth Henstridge 饰）以及来自黑客构成的民间团体涨潮组织的斯凯（科洛·本内特 Chloe Bennet 饰）加入进来。 他们以一己凡人之力，投入到各种匪夷所思且疑云重重的危险事件的调查中去……

Season 2 of 神盾局特工 premiered on September 23, 2014.

神盾局一沦陷，考森在尼克·弗瑞的允许下开始重建组织、收拾残局，而除了招募新人最重要的事情，就是必须创建起与政府机构的信任桥梁。同时，考森在领队在世界各地全力搜查“九头蛇”余党的踪迹，而昔日的伙伴如今沦为背叛者的沃德则是成为了他们唯一的线索。考森感觉自己当初复活期间所产生的“副作用”时不时会涌上心头，也发觉自己的自控能力越来越差，死命刻墙图、甚至为了查明真相而派队员去送死，屡次让神盾局陷入更大的危机。更吃惊的是，丝凯失散多年的父亲突然回归，并在身后也有一个从古到今毫无任何人见过的“异人”组成的联盟。丝凯因此再度为自己的身世产生疑问，也陷入了选择家人或者伙伴、左右为难的局面

Season 3 of 神盾局特工 premiered on September 29, 2015.

神盾局在经历了与异人族之间的战争之后，激发异人的元素不慎扩散到了全世界，而如今获得异能控制能力的黛西开始积极找寻世界各地进化成异人的人类，并设法协助他们学会控制能力并保护他们。但全世界自从经历了多个外星灾难之后开始对外星生物感到极度恐慌，而由政府创立的新行动小组“高级威胁控制组”却每次都抢先一步找到他们。当考森试图与小组的领导人沟通时，意外得知他们每次找到的顶多只是尸体，于是两方怀疑在他们之间还有另外一伙人马在从中作乱。而一波未平、一波又起，群龙无首的“九头蛇”在沃德的组建下开始另起炉灶，考森不仅要负责调查外星文明来调查异人族，也要试图救出被困在“另外一端”的一分子，甚至世界也再度对神盾局失去了信心。

Season 4 of 神盾局特工 premiered on September 20, 2016.

“英雄内战”的影响下，神盾局在联合国的规定与《索科维亚协议》的连带责任，回归成为美国政府的直属机构，遵循着未经联合国许可与监督不可擅自行动的约束。这项法案使得众人的行动变得不自在，人工智能的制造也受到不小的冲击。悄悄隐退的黛西，开始利用自己的特殊能力“震波”维持街头秩序，却也造成了市民的恐惧。此举俨然违反联合国的规范，而考森由于卸下局长一职、变回一个普通特工，因此只能无动于衷地听从新上司的安排。与此同时，一个类似于异人的“恶灵骑士”在街头现身，除了黛西想一探究竟外，神盾局也不遗余力，揭开这位私刑者的神秘面纱。另一方面，神盾局之前结识的超人类主义学家霍登·雷德克里夫，开始着手研发另一层次的人工智能，而他的成果也会掀起一场风暴

Season 5 of 神盾局特工 premiered on December 1, 2017.

一个“小机遇”让考森为首的众神盾局特工们集体穿越至74年后的未来：一个发生过毁灭性灾难而沦为人间地狱的地球；幸存的人类不仅全数躲入地下基地苟延残喘的生活下去，每天还遭受于未来统治人类的克里人摧残。不知自己为何来此的考森等人，因“无家可归”只好尽量融入环境，想办法带领人民抗击克里人势力，并极力查找回家方法。过程中充满艰辛苦难，目睹人们伤亡惨重，甚至从未来历史中得知毁灭地球的元凶就是神盾局里的一员。当考森借助帮忙而好不容易回到过去现代后，想办法打破这条“时间轮回”中止未来惨剧发生，但他们试图阻止的一切，反而开始应验未来……

Season 6 of 神盾局特工 premiered on May 10, 2019.

在本季开始，由萨吉（克拉克·格雷格 饰）领衔的一组来自外星球的小队穿越来到地球。他们来者不善，也做了些杀人抢劫的坏事。他们的目标很明确，干掉毁灭了无数星球的艾泽尔。而神盾局一头，西蒙斯和黛西勇闯银河系，找回流浪在外太空中的菲兹。（至于猴子为什么会流浪，这个故事你需要看完整个第五季），当大家都很好奇并纠结萨吉和寇森关系的时候，直到本季接近尾声，所有真相才浮出水面。

Season 7 of 神盾局特工 premiered on May 27, 2020.

漫威宇宙的特工穿越时空，试图阻止好斗的外星人Chronicom入侵地球。