Риз и Финч пытаются спасти исходный код машины, прежде чем он станет не ремонтопригоден. Кроме того, Рут борется за свою жизнь против натиска агентов «Самаритянина», а Фаско сталкивается с трудными вопросами после гибели Доминика и Элайаса.

Машина испытывает сбой во время перезагрузки, передавая Ризу и Фаско номера десятков людей, на самом деле не относящихся к совершаемым преступлениям. А также блокирует Финча и Рут после их идентификации, найдя в них угрозу и основываясь на их прошлом агрессивном поведении.

Прошлое и настоящее сталкиваются, когда последний номер команды расследует смерть своего брата, которого убил ... Риз, когда работал на ЦРУ.

Шоу сбегает от своих тюремщиков, но команда Машины не уверена в психологическом состоянии Самин, когда та начинает совершать рискованные и необдуманные поступки.

Риз защищает аналитика нью-йоркской полиции по имени Итан Гарвин, который работает с очень сложной акустической системой наблюдения под названием "ShotSeeker", предназначенной для обнаружения выстрелов в любой точке города. Кроме того, Ризу и Фаско угрожает Брюс Моран, близкий друг Элаиса, который хочет выяснить обстоятельства его гибели и отомстить за смерть своего друга. Тем временем Финч и Рут проектируют серию эмуляций в клетке Фарадея между фрагментами кода Машины и Самаритянина, чтобы дать Машине возможность изучить код Самаритянина.

Машина отправляет Финча и Риза на свадьбу, чтобы защитить жениха и невесту перед их бракосочетанием. Тем временем Фаско теряет терпение из-за того, что команда Машины держит его в неведении, и берет на себя расследование череды дел о пропаже людей.

Рут под прикрытием отправляется на радиостанцию, чтобы защитить ведущего передачи о теориях заговора, наткнувшегося на информацию, которая может привести к его гибели. Также агенты Самаритянина пытаются убедить члена команды, что они преследуют благородные цели.

Риз и Финч оказываются запертыми в больнице, которая становится эпицентром смертельной вирусной вспышки. Также у нового рекрута Самаритянина появляются сомнения, а у Шоу по-прежнему проблемы с реальностью.

Таинственный преступный ум, известный как "Голос", возвращается и устраивает ловушку для Риза и Фаско в их собственном участке вместе с вооруженными членами банд и последним номером. Также Рут делает шокирующее открытие.

Выпадает номер Финча, когда фатальная ошибка приводит к раскрытию его личности и растущей серии стычек с оперативниками Самаритянина.

Команда должна раскрыть заговор и быть вперед Секретной Службы, когда новым номером становится Президент Соединенных Штатов. Также Финч отделяется от команды, решая принять радикальные меры по борьбе с Самаритянином.

Пока Риз и Шоу бегут по следу Финча, он проникает в максимально-защищённое государственное учреждение с миссией, которая может стать не только концом Самаритянина, но и его самого и Машины.

Финч, Риз, Фаско и Шоу берутся за последнюю миссию, чтобы предотвратить уничтожение Машины Самаритянином и укрепление его господства над миром.