Los corruptos creadores de la Casa de Muñecas, un centro de alta tecnología, ganan millones de dólares reprogramando sin parar a Echo y los demás activos para satisfacer todas las demandas de sus clientes, solucionando sus problemas o proporcionándoles todos sus caprichos.

Un psicópata convierte el tiempo que pasa con Echo en una cacería mortal, mientras Boyd, al que han dejado imposibilitado, no puede protegerla; y el agente Ballard consigue la primera pieza del rompecabezas que le permitirá demostrar la existencia de Dollhouse.

Echo lidera con éxito una misión con un equipo experto en cajas fuertes cuando una llamada de teléfono le borra la memoria; Sierra debe asumir la misma personalidad para cumplir la misión; y el agente Ballard da un ultimátum a Lubov.

Echo, esta vez una mujer ciega e inocente, salva a los seguidores del malvado líder de una secta; y la realidad de la existencia de Dollhouse queda cada vez más clara para el Agente Ballard cuando ve por primera vez a la mujer que él conoce como Caroline.

Ballard irrumpe en una casa propiedad de un magnate de Internet que está muy apenado, y se encuentra con Echo inesperadamente; cuando se vuelven a encontrar, Echo lo mete en una pelea a puñetazos.

Una misteriosa droga que afecta la memoria de todos los alumnos de una universidad hace que Echo regrese al lugar donde comenzó todo, y el personal de Dollhouse al completo cae víctima del alucinógeno.

Echo ayuda a liberar a los Activos; recuerdan partes de sus verdaderas personalidades, y descubren los dolorosos motivos que los llevaron a decidir entrar en Dollhouse.

La personalidad en desarrollo de Echo la lleva a solicitar que le asignen la misión de salvar la Casa de Muñecos de un ataque encubierto; mientras, la programación de Mellie incluye una advertencia oculta para Paul.

Una mujer rica sospecha que está a punto de morir, de modo que decide dejar sus recuerdos en Dollhouse para poder regresar y descubrir a su asesino; y Paul descubre pruebas de que Mellie es una muñeca.

El deseo de Paul de salvar a Echo lo empuja a meterse de lleno en lo desconocido cuando descubre cómo infiltrarse en Dollhouse.

Alpha programa a Echo para que se una a él en su fiebre asesina, y de paso planea acabar con su verdadera identidad.