Nakon što je neočekivani identitet Nathanova (Adrian Pasdar) ubojice otkriven te odmah nakon ostavljanja Petera (Milo Ventimiglia) i Matta (Greg Gunberg) u neočekivanom, neoznačenom području, heroji kreću u novo poglavlje. S djelomično vraćenim moćima Sylar (Zachary Quinto) odlučuje da bi mu posjet Claire (Hayden Panettiere) mogao dodatno pomoći. U međuvremenu, u Tokiu, Hirou (Masi Oka) i Andu (James Kyson Lee) povjereno je čuvanje obiteljske tajne koja bi mogla uništiti svijet, a oni otkrivaju da put u tamnu budućnost počinje sa sumnjivom super brzom Daphne (Brea Grant). U New Yorku, zahvaljujući Mayi (Dania Ramirez), Suresh (Sendhil Ramamurthy) otkriva nešto zapanjujuće što bi moglo promijeniti svijet – ili samo uništiti njegov.

Angela (Cristine Rose) se suočava s promijenjenim sinom Peterom (Milo Ventimiglia), dok ispadi nasilja oko njih samo nagoviještaju nadolazeće katastrofe. Prvo Sylar (Zachary Quinto) objavljuje rat Kompaniji napadajući njihov glavni objekt i na Petoj razini nalazi više od onog čemu se nadao. Tijekom razarajuće bitke s Elle (Kristen Bell), desetak divljih kriminalaca sa strahovitim moćima – pobjegne. U međuvremenu Claire (Hayden Panettiere) otkriva nešto novo i neočekivano u vezi s njezinim moćima. Odlučan da vrati strašnu obiteljsku tajnu, Hiro (Masi Oka) i Ando (James Kyson Lee) slijede Daphne (Brea Grant) u Pariz. Zaglavljen na nepoznatom teritoriju Matt (Greg Gunberg) pronalazi vodiča (Ntare Mwine) da mu pomogne.

Kada četiri nemilosrdna, moćna Zločinca – Knox (Jaime Hector), Flint (Blake Shields), Nijemac (Ken Lally) i Jesse (Francis Capra) ulete u banku i uzmu taoce, Angela (Cristine Rose) šalje H.R.G.-ja (Jack Coleman) i njegova partnera za njima. Odlučan da odgodi kataklizmičku budućnost, Peter (Milo Ventimiglia) mora prvo pronaći ono što je putem izgubio. U međuvremenu Hiro (Masi Oka) i Ando (James Kyson Lee) slijede Daphne (Brea Grant) i dio 'formule' u Njemačku, ali nisu slijedili pravila Haićana (Jimmy Jean-Louis). Prestravljena svojim moćima, Tracy Strauss (Ali Larter) napušta Washington da potraži odgovore na pitanja o Niki. Izbezumljena Claire (Hayden Panettiere) zamoli Meredith (Jessalyn Gilsig) da je nauči kako se boriti. Kako se njegova veza s Mayom (Dania Ramirez) pojačava, Suresh (Sendhil Ramamurthy) otkriva da nije spreman.

Nakon što je vidio budućnost u kojoj gotovo svi imaju sposobnosti te svijet osuđen na uništenje, Peter odlučuje spriječiti taj destruktivni kraj i rabi mračnu moć s kojom se ne može upravljati. Nakon što su dopustili da Angelinina polovica 'formule' bude ukradena, Hiro i Ando (James Kyson Lee) kreću razotkriti identitet Zločinca koji je unajmio Daphne (Brea Grant) i moraju se posavjetovati s osobom koja najbolje poznaje odmetnute, Adamom Monroeom (David Anders). Nakon krvoprolića u banci, H.R.G. (Jack Coleman) se odlučuje riješiti novog partnera. U međuvremenu, odlučna da bude heroj, Claire kreće u potragu za jednim od Zločinaca iz H.R.G.-ova starog dosjea.

Naoružana H.R.G.-ovim (Jack Coleman) starim dosjeom i elektrošokerom, Claire (Hayden Panettiere) pokušava srediti svoju prvu metu - Stephena Canfielda (Andre Royo), bjegunca s pete razine koji ima sposobnost stvaranja crnih rupa. U međuvremenu, Peter (Milo Ventimiglia) u strahu bježi od smrti i uništenja iz budućnosti, da bi nažalost doznao kako ga je iskustvo uvelike promijenilo. Frustriran što ih Adam Monroe (David Anders) nije doveo bliže 'formuli', Hiro (Masi Oka) se pokušava sprijateljiti s Daphne (Brea Grant) i novim suradnikom Knoxom (Jaime Hector).

Zadivljeni njegovom iznenadnom nemilosrdnošću, Zločinci Knox (Jamie Hector) i Daphne (Brea Grant) dovode Hiroa (Masi Oka) u Pinehearst Fold i daju mu zadatak. Angela (Cristine Rose) i Kompanija paralizirani su nedavnim događajima i Peter (Milo Ventimiglia) odlazi ravno u Pinehearst po odgovore te je nepovratno promijenjen šokantnim susretom.

U gostujućoj ulozi pojavljuje se Eric Roberts. Da se pripremi na sukob koji slijedi, Hiro (Masi Oka) slijedi uglednog biznismena, supruga i oca Arthura Petrellija (Robert Forster) u danima prije njegove 'smrti' – da bi otkrio što ga je navelo da stvori rivalsku kompaniju Pinehearst i napadne Angelu (Cristine Rose). Poslije, u jednom je trenutku Sylar (Zachary Quinto), prestravljen i shrvan osjećajem krivnje, mogao zaustaviti svoju ubojitu potragu za sposobnostima – to jest, da su H.R.G. (Jack Coleman) i Elle (Kristen Bell) odustali od njihova groznog zadatka. Na kraju, pod vodstvom čovjeka iz Kompanije Thompsona (Eric Roberts) agentica na obuci Meredith (Jessalyn Gelsig) gleda kako joj se novi život raspada nakon dolaska njezina brata

Nakon preventivnog napada na Hiroa (Masi Oka) i Anda (James Kyson Lee) u Africi, Arthur Petrelli (Robert Forster) naređuje Knoxu (Jamie Hector) i Flintu (Blake Shields) da pronađu njegova sina Petera (Milo Ventimiglia) i unuku Claire. Nathan (Adrian Pasdar) je zaprepašten kad čuje da mu je otac živ – i vodi zločinačke destruktivne napade širom svijeta. U međuvremenu, u Pinehearstu, Sylar (Zachary Quinto) ima žestoki okršaj s Elle (Kristen Bell). Suresh (Sendhil Ramamurthy) započinje s testovima nove, kombinirane formule supermoći. Poslije, dok su drugi mrtvi, ozlijeđeni ili u bijegu, Matt (Greg Grunberg) pokušava probuditi Angelu (Cristine Rose).

Nakon povezivanja Sylara (Zachary Quinto) i Elle (Kristen Bell), Arthur (Robert Forster) naređuje im da pronađu Claire (Hayden Panettiere) i dovedu je k njemu. Matt (Greg Grunberg), Hiro (Masi Oka) i Ando (James Kyson Lee) udružuju se i prate Daphne (Brea Grant) do njezina rodnoga grada Lawrencea u Kanzasu da otkriju što skriva. U međuvremenu Nathan (Adrian Pasdar) i Peter Petrelli (Milo Ventimiglia) putuju zajedno na Haiti u potrazi za jedinim čovjekom koji može zaustaviti njihova oca da ne uništi svijet, Haićanina (Jimmy Jean-Louis)

U gostujućoj ulozi pojavljuje se Seth Green. Pomrčina se nastavlja i utječe na sposobnosti Heroja dok se Elle (Kristen Bell) i Sylar (Zachary Quinto) bore protiv osvetoljubivog H.R.G.-ja (Jack Coleman), a Claire se (Hayden Panettiere) bori za život. Na Haitiju se Peter (Milo Ventimiglia) i Nathan (Adrian Pasdar) udružuju s Haićaninom (Jimmy Jean-Louis) u borbi protiv njegova brata, Barona Samedija (Demetrius Grosse), a Nathan donosi šokantnu odluku. U međuvremenu, Ando (James Kyson Lee), Sam (Seth Green) i Frack (Breckin Meyer) pomažu Hirou (Masi Oka) da vrati sjećanje uz pomoć stripa '9th Wonders' u lokalnoj prodavaonici stripova.

U nadi da će zaustaviti Arthura (Robert Forster), Hiro (Masi Oka) i Claire (Hayden Panettiere) udružuju se i putuju 16 godina unatrag kada je Kaito (George Takei) dao malu Claire H.R.G.-ju (Jack Coleman). U međuvremenu, Peter (Milo Ventimiglia) i Haićanin (Jimmy Jean-Louis) udružuju se da zauvijek srede Arthura Petrellija, ali ometa ih Sylar (Zachary Quinto). Na drugome mjestu, u laboratoriju, Suresh (Sendhil Ramamurthy) postiže veliko dostignuće s formulom koja će vjerojatno sve promijeniti.

Nakon borbe protiv Arthura Petrellija, braća Petrelli (bore se jedan protiv drugog, a Nathan čini potez koji će imati posljedice svjetskih razmjera. U međuvremenu Sylar (Zachary Quinto) drži Claire (Hayden Panettiere), H.R.G.-ja (Jack Coleman), Meredith (Jessalyn Gilsig) i Angelu (Cristine Rose) kao taoce u Primatechu i slijedi okršaj. Na drugome mjestu, Ando (James Kyson Lee), Matt (Greg Grunberg) i Daphne (Brea Grant) i dalje pokušavaju osloboditi Hiroa (Masi Oka) - a doktor Suresh (Sendhil Ramamurthy) im je možda jedina nada

Mjesecima nakon što su u eksploziji nestali Pinehurst i Primatech, naši Heroji pokušavaju ostaviti prošlost i započinju nove živote. Sada bez moći, Hiro (Masi Oka) pokušava trenirati neodlučnog Anda (James Kyson Lee) da bude istinski superheroj. Suresh (Sendhil Ramamurthy) se vraća životu vozača taksija, Peter (Milo Ventimiglia) opet spašava živote, a Daphne (Brea Grant) i Matt (Greg Grunberg) trude se živjeti kao običan par. Clairein (Hayden Panettiere) pokušaj da živi normalnim životom naglo je prekinut kad otkrije smrtonosnu zavjeru koju vodi Nathan (Adrian Pasdar) koji namjerava loviti i zatvoriti one s moćima. U međuvremenu, Sylar (Zachary Quinto) počinje potragu za svojim pravim roditeljima

Nakon niza neočekivanih događaja, naši Heroji bježe od najnovijeg protivnika i jednog od njih, Nathana (Adrian Pasdar). Nakon što Matt (Greg Grunberg) naslika seriju proročkih slika, otkriva se tragična sudbina nekog njemu bliskog. Na drugome mjestu, Sylar (Zachary Quinto) nastavlja potragu za svojim ocem i nailazi na mladog odbačenika (Dan Byrd) koji ima informacije i vlastitu moć.

Nathanov (Adrian Pasdar) plan izlazi na vidjelo kad Domovinska sigurnost započinje istragu na izravnu zapovijed predsjednika Sjedinjenih Država. Sylar (Zachary Quinto) i Luke (Dan Byrd) upuštaju se u potragu za Sylarovim ocem, ali ih potajice love Nathanovi agenti. Život se zakomplicira obitelji Bennet kad Claire (Hayden Panettiere) kreće u akciju da zaštiti mladića s moćima (Justin Baldoni) da ga ne uhiti H.R.G. (Jack Coleman). Na drugome mjestu, Mattove (Greg Grunberg) proročke slike vode Hiroa (Masi Oka) i Anda (James Kyson Lee) u Indiju gdje tajnoviti saveznik priskače u pomoć našim Herojima.

U gostujućoj ulozi pojavljuje se Željjko Ivanek. H.R.G. (Jack Coleman) podvrgnut je unikatnom načinu ispitivanja Matta Parkmana (Greg Grunberg) koji otkriva u kojoj je vezi s Nathanovim (Adrian Pasdar) vladinim planom da uhvati one s moćima. U međuvremenu, Mattova otkrića dovode Petera (Milo Ventimiglia) oči u oči s 'Lovcem' (Zeljko Ivanek).

Nakon što dobiju dojavu od 'Pobunjenika', Matt (Greg Grunberg) i Peter (Milo Ventimiglia) jure u 'Zgradu 26' da spase Daphne i pronađu dosjee koji će razotkriti vladine planove za one s moćima. Claire (Hayden Panettiere) nailazi na neočekivanu pomoć u krijumčarenju Alexa (Justin Baldoni) iz grada. Dok Sylar (Zachary Quinto) i Luke (Dan Byrd) nastavljaju s putovanjem, Sylar se počinje prisjećati oca, što ga dovodi do istine o majci. U međuvremenu, 'Lovac' (Zeljko Ivanek) pokreće svoj plan s eksplozivnim iznenađenjem za jednog od naših Heroja.

U gostujućoj ulozi pojavljuje se John Glover. Kada Sylar (Zachary Quinto) dođe uči u oči s davno izgubljenim ocem (John Glover), susret postaje onakav kakvom se najmanje nadao. Na drugome mjestu, nakon dojave 'Pobunjenika', Claire (Hayden Panettiere) mora odlučiti hoće li pomoći zakletom neprijatelju Ericu Doyleu (David Lawrence XVII.) da izbjegne uhićenje. U međuvremenu, dok 'Lovac' (Zeljko Ivanek) planira otkriti tajne obitelji Petrelli da bi preuzeo kontrolu nad Nathanovom (Adrian Pasdar) operacijom, Matt (Greg Grunberg) se nalazi u centru pozornosti i na rubu je toga da sravni Capitol Hill sa zemljom.

H.R.G. (Jack Coleman) uvjerava Emilea Danka (Zeljko Ivanek), poznatijeg kao 'Lovca', da oslobodi Tracy (Ali Larter) iz 'Zgrade 26', u nadi da će ih ona odvesti do 'Pobunjenika'. Angela (Cristine Rose) izbjegava uhićenje i traži pomoć od stare prijateljice (Swoosie Kurtz). U Los Angelesu Hiro (Masi Oka) i Ando (James Kyson Lee) rješavaju zadnju 'Pobunjenikovu' misiju da zaštite najnovijeg heroja.

Nathanova (Adrian Pasdar) moć je otkrivena i on je izgubio kontrolu nad operacijom, stoga on i Claire (Hayden Panettiere) se skrivaju u Meksiku. Sad kada Emile Danko (Zeljko Ivanek) ima kontrolu nad vladinom operacijom, plan da uništiti sve s moćima pokreće se kad se udruži s neobičnim partnerom.

Dok Danko (Zeljko Ivanek) vodi vladinu operaciju, netko njemu blizak nalazi se na vatrenoj liniji. H.R.G-ju (Jack Coleman) život i dalje izmiče kontroli i brak mu je na rubu prekida. U međuvremenu, Hiro (Masi Oka) i Ando (James Kyson Lee) nastavljaju put kojem je cilj posebna dostava za Matta Parkmana (Greg Grunberg). Na drugome mjestu, Angela Petrelli (Cristine Rose) oživljava demone svoje prošlosti

Dok Nathan (Adrian Pasdar), Claire (Hayden Panettiere), Peter (Milo Ventimiglia) i H.R.G. (Jack Coleman) pomažu Angeli (Cristine Rose) da otkrije svoju prošlost, ona otkriva mračne tajne koje su je proganjale godinama. U međuvremenu, Mohinder (Sendhil Ramamurthy) doznaje za upletenost svog oca u davno zaboravljenu vladinu operaciju.

Sylar (Zachary Quinto) nastavlja neobično partnerstvo i počinje imati neočekivanu krizu identiteta. Hiro (Masi Oka) i Ando (James Kyson Lee) povlače poteze kojima bi srušili 'Zgradu 26'. U međuvremenu, Mattovo (Greg Grunberg) novostečeno očinstvo mijenja mu prioritete. Na drugome mjestu Nathan (Adrian Pasdar) pokreće plan da ispravi loše stvari počinjene njegovom vladinom operacijom.

Nathan (Adrian Pasdar) se sukobljava sa Sylarom (Zachary Quinto) da ga spriječi da se susretne s predsjednikom (Michael Dorn). Sylar ima planove za novog partnera. U međuvremenu, Hiro (Masi Oka) doznaje da njegovo vraćanje moći ima posljedice. Na drugome mjestu, Matt (Greg Grunberg) mora poduzeti posebne korake da zaštiti budućnost svoje obitelji