「超魔神」的故事發生在「魔神1」之後，作為獨立於「魔神2」的平行宇宙。曾經從多壞達手中拯救了創界山後沒多久的救世主戰部渡，邪惡帝王暗黑達在半夜趁機奪走他的善良之心，簡稱《善心》，使得他心地突然變得很壞，變成了不良少年，成為龍神鎮的老大，後來遇見火美子與劍部暫停一下，把他帶入創界山，但是由於沒有善心，他幾乎已經把救世主的記憶給忘光了，於是在新的敵人多納卡米家族的手下侵略整座創界山，布滿敵軍的炮火攻擊之下，他重啟了龍神丸，救世主的記憶在龍神號的甦醒之下恢復，並展開創界山的尋心之旅，用六位聖神的神聖之心與龍神丸結合為超魔神龍神丸，徹底粉碎暗黑達與多納卡米家族的野心。