奏多是一名滿懷抱負的漂擊者，他與知名的漂泊者時生至博物館遺跡探索時，發現了一名失去記憶的賢士。接著，洛克鎮因受到終結者的攻擊而陷入危險之中。

奏多回到他發現諾娃的博物館遺跡處並找尋關於她過去回憶的線索。當一名來自百家樂巢穴的犯罪組織首腦朗格，試圖誘拐諾娃離開洛克鎮時，她遇見了具有天使般嗓音的賢士夏爾。

奏多現在是諾娃的主人，也即將順利成為正式的漂泊者。時生宣稱他將帶奏多去慾之巢穴，那是一座歡愉之城，並想教他成為真正的男子漢。當艾莉、安潔及諾娃知道之後，她們便趕至慾之巢穴將奏多帶回家。

奏多為了訓練自己變得更強大，以不依賴諾娃的方式，單獨挑戰終結者。幸好有個靈柩機甲及時出現並以遠程射擊擊倒了終結者，否則他幾乎潰敗。他的救命恩人為克勞蒂亞和她的賢士搭檔芙蘭。他們向奏多提出了特殊請求。

奏多知道他必須強化與賢士的連結，才能成為更強大的漂泊者，於是他和諾娃一同前往費思迷宮。同時，時生得知某異形族群會專門攻擊阿美西亞零式型賢士與其漂泊者。

奏多和時生尋找AO水晶時遇到藍鑠毒雨，因此時生建議他們先至附近百家樂巢穴內的賭城避雨。在賭城中，他們巧遇隻身在大廳唱歌的賢士夏爾。她也是諾娃被朗格綁架時所遇見的特殊賢士。

為了找出更多關於諾娃的過去記憶，奏多請求瑪麗亞對諾娃進行修復工作。艾莉趁奏多的賢士停工時去照顧他，她發現曾被諾娃管理卻依舊凌亂不堪的家變得完美無瑕，原來是夏爾取而代之。

奏多邀請艾莉去衛星水世界。她很興奮能和奏多約會。但是當他們抵達目的地時，卻發現整個團隊夥伴們也在場。他們一群人都在泳池邊玩得很開心。當夏爾登台唱歌時，人群為她而瘋狂。

在前往交易者巢穴的路上，奏多目睹了一名孤單的漂擊者行走在毒雨之中。他們在交易者巢穴中再次相遇，漂泊者介紹自己是來自阿美西亞時代的老將阿爾巴，並告訴奏多他一直在尋找賢士。

洛克鎮四周的巢穴一直發生不明的大型毀滅攻擊事件。奏多試圖調查事件發生的起因，卻遭到時生的拒絕，他們倆為此互看不順眼。當洛克鎮的領導者命令他們一同負責調查行動時，兩人關係也趨於緊張，奏多拋下時生並獨自展開行動。

附近巢穴的漂泊者們趕往洛克鎮準備全力抵抗銀色風暴。此時，追捕諾娃的神秘集團趁機命令夏爾除掉奏多。 隨著戰鬥的拖延，漂泊者們開始失去所有生存的希望。

這是對抗銀色風暴戰鬥中的最後反擊。雖然所有人都傷痕累累，但奏多拒絕放棄，即便升級過的戴吉巨怪機甲也只能死拚活撐。這場殊死戰讓諾娃的憂慮的心達到巔峰，她開始發生了轉變。

與銀色風暴激戰後已經過了數日，在戰鬥中搖身變成奧秘士的諾娃仍無法回復她平時的自我。奏多帶著奧秘士重遊他和諾娃共享記憶的地方，希望藉此幫助喚醒諾娃。

奧秘士告知奏多西史多瓦是真實存在的地方，因為她和她的前主人過去曾在旅行中聯繫過西史多瓦的網絡。然而，若奏多想要成功到達西史多瓦，他需要接受更多的訓練。

為了尋找傳說之城西史多瓦的線索，奏多前往附近的迦太基，據說那裡有一個古老的太空港。而他快要取得進入西史多瓦的線索時，卻突然遭受攻擊。當奏多與襲擊者對峙，為了不失去他的賢士，他被迫面臨對決的挑戰。

諾娃得知奧秘士的自我修復程序一旦完成之後，她原有的性格將可能從此消失。她接受了她的命運，也相信奧秘士是奏多最好的夥伴。但奏多對於她的決定一無所知，因此他們內心想法並不一致。諾娃為了提供奏多最後一次服務，她決定為他下廚做飯。

諾娃輕率的舉動造成她與奧秘士兩賢士皆停止運作。當她們倆無法被喚醒時，奏多轉向阿爾巴求助。然而，阿爾巴需要取得另一個原型賢士才能同時救回她們倆。而荒廢的阿美西亞地區或許還有找到原型賢士的機會，因此奏多與夏爾立即前往尋找。

奏多被他信任的盟友背叛，慘遭俘虜。更糟的是，他的另外兩位朋友竟然也是理想國的成員。情勢發展急轉直下，仮思海揭露了令人震驚的過去。

艾莉擔心奏多的安危，並前來尋找他的下落。她發現奏多處於震驚狀態，竟抱著一動也不動的夏爾並不斷責備自己。但能救回諾娃和奧秘士的時間已所剩無幾，他卻仍然無法做出選擇。最後，在一陣激烈的爭辯之中，奏多仍必須做出抉擇。

帕斯卡爾留下了訊息，詳細描述了諾娃與奧秘士的過去。那段往事始於他們第一次接觸西史多瓦的時刻。同時，馬特回憶起他和白雪連結的時光，那段回憶也揭露了理想國最初成立的背後秘密。

隨著對抗理想國的戰役即將來臨，奏多不斷忙著升級白菊武裝鬼怪的設備。同時，諾娃仍不敢相信夏爾就是拯救她的人。正當她四處閒蕩，她巧遇夏爾的粉絲，她們倆開始懷念起夏爾曾經演唱過的歌曲，因此諾娃告訴奏多她想嘗試歌唱。

瑪麗亞的火箭完成了，奏多終於可以親遊西史多瓦。然而，理想國居心叵測想試圖阻止他的計畫。仮思海命令馬特從奏多的眼皮底下偷走奧秘士，以示宣戰，因此洛克鎮的漂泊者們和理想國成員在一聲巨響中正式開戰。

奏多決定用最後一枚火箭追擊仮思海以奪回奧秘士。他和諾娃向洛克鎮的人們告別，最後終於到達西史多瓦，而仮思海已在那方迫不急待地等待他們的到來。

這一切原是仮思海策畫好的計謀，所有賢士也都停止運作。然而，諾娃因為出身獨特，她是唯一不受影響的賢士，因此她現在肩負所有的期望。而奏多和諾娃與仮思海對決的時候到了，這是他們的最後一戰。