丸菱商事に勤める乃木憂助（堺雅人）は、誤送金された１３０億円を取り戻すべく、送金先であるバルカ共和国へ向かった。その後、乃木は誤送金の犯人だと疑われ、１３０億円を取り戻さなければ懲戒解雇の危機に…！そんな中、バルカで爆発に巻き込まれた乃木は、爆破犯に間違えられ、バルカ警察に追われる羽目となる。現地で出会った公安警察の野崎守（阿部寛）と医師の柚木薫（二階堂ふみ）と共に、乃木はバルカを脱出するために奔走する…。果たして乃木は、１３０億円を取り戻すことができるのか？そして、鍵を握る「VIVANT」とは一体何なのか？

公安の刑事・野崎（阿部寛）の助けで現地警察の追跡から逃れ、無事日本大使館へとたどり着いた乃木（堺雅人）と薫（二階堂ふみ）。しかしいつまでも、止まっているわけにはいかない乃木は、130億円を取り返すべく動き出す。果たして、130億円の奪還なるか!?また、野崎はザイール（Erkhembayar Ganbold）の残した「ヴィヴァン」という言葉に引っかかっていた。そして、明かされる「ヴィヴァン」の謎に驚愕する一同。「ヴィヴァン」をめぐる物語が遂に動き出す。

日本大使・西岡（檀れい）の裏切りに気付いた乃木（堺雅人）たち。バルカ警察から逃れ日本へ脱出するには、バルカ人も決して足を踏み入れない“死の砂漠”を突破するしかなかった！　一か八か、死と隣り合わせの砂漠の横断が始まった。しかし、薫（二階堂ふみ）を乗せたラクダから薫の姿が消えていた。そのことに気づかず、進んでいく一行。薫、そして乃木、野崎（阿部寛）の運命は？そして、誤送金を引き起こした人物がついに正体を現す！

システムを改ざんして誤送金を仕組んだ人物が、財務の太田（飯沼愛）だと突き止めた乃木（堺雅人）たち。野崎（阿部寛）たち公安は、太田の自宅へ急行するのだが…。ついに誤送金事件が完結！ 事件の真相が明らかになったとき、誰も予想できない、衝撃の展開が待ち受ける！

乃木（堺雅人）の正体はなんと、国内外で民間人に紛れて諜報活動を行う特殊部隊“別班”だった！ 同じく別班の黒須（松坂桃李）とともに、テロ組織“テント”のモニターである山本（迫田孝也）を排除した乃木は、次の目的のため、ある人物の元を訪れる。一方、山本の死に違和感を抱いた野崎（阿部寛）は、自分たち公安以外に唯一山本の正体を知っていた乃木に疑惑の目を向ける。野崎が徹底的に乃木を調べる中、衝撃の過去が明らかになっていく。それぞれの運命を繋ぐ鍵は、壮絶なる“想い”…。

乃木（堺雅人）は、“テント”のリーダーであるノゴーン・ベキ（役所広司）が、幼い頃に生き別れた父だと確信し愕然とする。一方野崎（阿部寛）もまた、乃木家の家紋とテントの犯行現場に残されたマークの類似に気付き、乃木とテントの関係にたどり着いていた。“テント”の実体とは？ いよいよその謎に迫っていく。さらに、明かされるFの秘密、乃木の正体を追う野崎ら公安、そして、遂に行われるジャミーン（Nandin-Erdene Khongorzul）の手術の行方は…怒涛の後半戦が幕を開ける!!

ブルーウォーカー・太田（飯沼愛）の協力で、テントのサーバーからある重要な情報を得ることに成功した乃木（堺雅人）たち。そんな中、乃木、黒須（松坂桃李）をはじめとする6名の“別班”精鋭部隊が、司令・櫻井（キムラ緑子）の下に集結した。目的は、テントの最終標的である日本での犯行を未然に防ぐこと。そこで乃木は別班メンバーに、テントのリーダー・ベキ（役所広司）が自身の父であり、元公安の警察官だったと打ち明ける。徐々にテントへと近付いていく乃木たち別班、そして、チンギス（Barslkhagva Batbold）と手を組み、乃木を徹底的にマークする野崎（阿部寛）たち公安。テントの真相を暴き、日本を守るのはどちらか——。

乃木（堺雅人）たち別班はテントの会合に潜入し、ノコル（二宮和也）を捕らえる。しかし、乃木は次の瞬間、別班の仲間を次々と狙撃するという衝撃の行動に出た。別班、ひいては国を裏切ってまでも乃木が果たしたい“想い”。そして訪れる父・ベキ（役所広司）との40年越しの再会...。別班を裏切った乃木、テントのリーダー・ベキ、幹部としてベキを支えてきたノコル、それぞれの想いが絡み合い、予測不能な物語が紡がれる。

テントは、テロや犯罪行為を他から請け負うことで収益を得て、その金でバルカ国内の孤児たちを救っていたことが判明。そんな中、ベキ（役所広司）はノコル（二宮和也）に、ノコルが運営する会社で乃木（堺雅人）を働かせるようにと指示を出す。果たしてベキの真意は…。ベキのもと、協力体制を敷くことになった“宿命の兄弟”！そして乃木が知ることとなる、父・ベキの過去と、テント誕生の秘密とは！？