オセアニア軍が占拠している南海の孤島。オセアニア軍にとって海路の要衝となっているその島を北米同盟軍が強襲した。島に駐留するオセアニア軍を殲滅した北米軍は、その勢いのままレジスタンス組織に襲いかかる。

北米軍の襲撃を受けたヒヌカンの窮地を救ったのは正体不明のAMAIMだった。そのパイロット、三澤ジンが運び込んだ補給物資で装備を調えた知念イブキたちヒヌカンの一同は北米軍との戦いに臨む。

ヒヌカンと北米軍との戦闘が始まる。三澤は敵の指揮官グレイディ・エリソンと、イブキは安良城隊長とともに敵の副官機と対峙する。しかし、これが初実戦となるイブキの表情は固く、緊張に覆われていて……。

ヒヌカンと北米軍との戦闘は終わった。しかし北米軍はすぐに戦力を補充。一方でヒヌカンは安良城隊長を失い、イブキも心に傷を負った。敵と戦い、人を倒したという現実。そんな彼に三澤が自分の過去を話し始める。

ついにヒヌカンと北米軍との決戦が開始される。島全土に渡るローラー作戦を実行する北米軍、それに対しヒヌカンは三澤から教わったゲリラ戦術で対抗。イブキは人と戦う覚悟を持って敵AMAIMと対峙する。

敵機との戦いで九死に一生を得たイブキは、AMAIMを捨てて島から撤退するよう指示される。三澤とエリソンはお互い長い因縁に決着をつけることを望んでいる。いま肉体を削り合うような激しい戦闘が始まる。