"Unknown" is a mysterious enemy that suddenly appeared a long time ago. As a countermeasure, the "Evolutionary Railway Development Agency" (ERDA) has developed the "Shinkalion" robot that transform into bullet trains, to prepare for the threat.

"I want to be a cool person who can protect something..." Taisei Oonari, a second-year junior high school student, transfers to Shinkai Gakuen Middle School in search of clues about his older sister who disappeared two years ago.

Just then, the Unknown appears for the first time in 10 years. Taisei happens to have a high aptitude value as a Shinkalion pilot, and is forced to make a decision to fight it. What is the true nature of the Unknown and what is its purpose? What is the truth that comes to light at the end of the fight? The story of the boys' determination and growth begins now.

Érase una vez un enemigo no identificado, el Desconocido, que apareció de repente. La "Agencia de Desarrollo Ferroviario Súper Evolutivo" ha desarrollado el "Shinkalion", un robot que se transforma en un tren bala, como contramedida contra esta amenaza

“未知”是很久以前突然出现的一个神秘的敌人。作为应对措施，“进化铁路发展局”（ERDA）开发了“Shinkalion”机器人，可以变身为子弹头列车，为应对威胁做好准备。

“我想成为一个能保护某些东西的酷人……”初中二年级的学生大城泰成（Taisei Oonari）为了寻找两年前失踪的姐姐的线索，转学到新开学园中学。

就在那时，“未知”出现了10年来的第一次。泰曦作为一名新卡里昂飞行员，碰巧有很高的天赋值，被迫决定与之对抗。未知的真实本质是什么，它的目的是什么？战斗结束后，真相是什么？男孩们决心和成长的故事现在开始了。

かつて、突如として現れた正体不明の敵・アンノウン。「超進化鉄道開発機構」通称「ERDA（エルダ）」は、対抗手段として新幹線が変形するロボット「シンカリオン」を開発し、脅威に備えていた。「何かを守れる、カッコイイ人に…僕は…」中学２年生の大成タイセイは、2年前に失踪した姉の手がかりを求めて、進開学園中等部に転入する。その矢先、10年ぶりにアンノウンが出現。偶然にもタイセイがシンカリオン運転士として高い適性値を持つことが判明し、闘う決断を迫られることとなる。アンノウンの正体、そして目的は何なのか…。闘いの末に見えてきた真実とは…。少年たちの決意と成長の物語が、今、始まる―。

Er was eens een ongeïdentificeerde vijand, de Onbekende, die plotseling verscheen. De 'Super Evolutionary Railway Development Agency' heeft de 'Shinkalion' ontwikkeld, een robot die verandert in een kogeltrein, als tegenmaatregel tegen deze dreiging

"Unkown" é um inimigo misterioso que apareceu de repente há muito tempo. Como contramedida, a "Agência Evolucionária de Desenvolvimento Ferroviário" (“Evolutionary Railway Development Agency”, ou ERDA) desenvolveu o "Shinkalion", robôs que se transformam em trens-bala, para se preparar para a ameaça. Taisei Ohnari, um estudante do segundo ano do ensino médio, se transfere para a Escola Secundária Shinkai Gakuen em busca de pistas sobre sua irmã mais velha, que desapareceu há dois anos. Só então, Unkown aparece pela primeira vez em 10 anos. Acontece que Taisei tem um alto grau de aptidão como piloto de Shinkalion e é forçado a tomar a decisão de combatê-lo. Qual é a verdadeira natureza de Unkown e qual é o seu propósito? Qual é a verdade que vem à tona no final da luta?