Mushishi: O próximo capítulo continua a história de Mushishi Ginko em sua jornada para ajudar o mundo visível a coexistir com os Mushi. Durante suas viagens, Ginko descobre vários indivíduos talentosos - aqueles amaldiçoados pelas circunstâncias e aqueles que mantêm uma simbiose frágil com os Mushi - inevitavelmente confrontando a questão de saber se a humanidade, talentosa e torturada, pode administrar a responsabilidade do invisível. Além disso, como Mushishi, Ginko deve aprender mais sobre esses seres estranhos e decidir se tem o direito de interferir nas complexas relações entre Mushi e a humanidade.