Una ciudad enorme en el oeste de Tokio con una población total de 2,3 millones. Alrededor del 80% de la población son estudiantes, por lo que la ciudad se llama 'Ciudad Academia', donde se estaba llevando a cabo el poder de torcer las leyes del mundo y causar fenómenos paranormales: el desarrollo de poderes sobrenaturales. Los estudiantes que han adquirido habilidades a través de clases especiales (plan de estudios) se someten a 'exámenes físicos (escaneos del sistema)' regulares y pasan por seis etapas desde 'incompetencia (nivel 0)' hasta 'poder sobrenatural (nivel 5)'. Parados en la cima y promocionados como los más fuertes están los siete 'psíquicos'. Una de ellas es Mikoto Misaka. Ella es una niña de 14 años que asiste a la escuela secundaria Tokiwadai Junior High School, una prestigiosa escuela para señoritas, y es conocida como Railgun.