Kamijo corre para encontrar Index e, pelo caminho, encontra Mikoto. Um grupo de cavaleiros aparece em Academy City.

Um livro de feitiços foi roubado e a freira que sabe descodificá-lo foi capturada. Stiyl é enviado para resolver o caso.

Kamijo vê Orsola ser raptada pelos Amakusa e vai com Stiyl e as Agnese ao esconderijo do inimigo.

Após resgatar Orsola, Kamijo é aconselhado por Tatemiya a não a entregar aos Amakusa, o que o deixa com uma decisão difícil em mãos.

Kamijo e Index veem-se encurralados depois de serem atacados. O seu destino depende da descodificação de um livro de feitiços.

Enquanto vai às compras com Mikoto, Kuroko recebe informações sobre uma mala que foi roubada e dirige-se, hesitante, aos escritórios do comité.

Kuroko persegue Musujime, uma jovem capaz de se teletransportar, e acaba por se ver em apuros. Musujime conta o seu plano a Kuroko.

Uma espada, que tem o poder de matar um santo, foi trazida para Academy City. Kamijo ajuda a procurar a perigosa arma e acaba por encontrar Oriana.

Kamijo e o restante grupo tentam apanhar Oriana, mas ela consegue escapar.

As intenções de Lidvia tornam-se claras. Kamijo tenta impedir que Index perceba o que se passa.

Os colegas de Kamijo ficam gravemente feridos depois do ataque de Oriana. Kamijo persegue-a e acaba por perceber qual é o seu plano.

Quando percebem que o destino de Oriana é o aeroporto, Kamijo e o grupo dirigem-se para lá. Mas conseguirão impedi-la de concretizar o seu plano?

Kamijo ganha uma viagem, para duas pessoas e preparar-se, eufórico, para partir com Index. Mas os dois acabam por envolver-se em problemas no aeroporto.

Kamijo e o seu grupo são subitamente atacados durante a estadia em Itália. A responsável é Agnese, que aceita deixá-los ir em liberdade, mas... com uma condição.

Durante uma luta, o grupo acaba por ser separado e Kamijo enfrenta Biagio.

Accelerator e os companheiros saem do hospital e ficam com Yomikawa. Ao regressar da sua desastrosa viagem a Itália, Kamijo é contactado por Mikoto.

Orsola e o grupo não se conseguem entender com a nova máquina de lavar. Kamijo depara-se com uma sucessão de problemas ao ser conduzido por Mikoto.

Accelerator e Last Order festejam o seu reencontro quando são interrompidos pelos Hound Dogs. Uma figura suspeita chega a Academy City.

Accelerator encontra-se com Index e espera pelo melhor momento para contra-atacar. Depois de escaparem aos Hound Dogs, Last Order e Kamijo deparam-se com um novo inimigo.

Accelerator está disposto a virar Academy City contra ele para salvar Last Order. Quando Vento e Kamijo estão prestes a iniciar o combate, algo muda na cidade.

Kihara e Accelerator defrontam-se. Kamijo usa todos os seus trunfos contra Vento, enquanto Index reza para tentar salvar a cidade.

Com o fim do reinado de terror de Vento, Kamijo e o grupo regressam às suas vidas normais mas, pelo mundo, começam a surgir protestos contra Academy City.

À medida que os protestos contra Academy City se intensificam, Misaka embebeda-se e começa a "aterrorizar" os alunos. Quem será a sua primeira vítima?