Makina Hoshimura, ein verstorbener Teenager, erhält ihren ersten Auftrag, tote Leichen auf der Erde zu beseitigen. Ihr Ziel ist Hagino, ein Krimineller, der beschuldigt wird, Frauen getötet zu haben, und der als Vampirleiche von den Toten auferstanden ist.

Nachdem mehrere Kinder, die bei einem Unfall auf der Autobahn ums Leben gekommen sind, als Leichen wieder auferstehen, wird Makina beauftragt, sie zu töten. Doch Ouri Kagami kommt ihm in die Quere, als eines der Kinder ihn anfleht, ihr bei der Flucht zu helfen. Keisei und eine Gruppe von Antileichenmönchen helfen Makina dabei, die Kinderleichen zu beseitigen.

Makina erhält den Auftrag, eine unbekannte Leiche zu jagen, die für die Tötung junger Frauen verantwortlich ist. Keisei erfährt, dass jemand, der mit Leichen vertraut ist, einen Arzt benutzt, um illegale Experimente an Leichen durchzuführen, um sie in Monster zu verwandeln.

Eine als Geländewagen getarnte Leiche streift im Großraum Tokio umher und tötet jeden, der es wagt, sie zu betreten. Keisei erzählt Ouri die wahre Natur seines Jobs, was zu seiner Suspendierung führt, wenn er Ouri nicht tötet. Ein neues Team von Shikabane Hime trifft ein, nämlich Itsuki Yamagami und ihr Vertragspriester Takamasa Sougi, um sich mit einem abtrünnigen Kougon-Kultpriester zu befassen.

Makina besiegt die SUV-Leiche, nachdem sie von Keisei unterstützt wurde. Der abtrünnige Priester entpuppt sich als Akasha, ein Mitglied des Kougun-Kults, der wegen seiner radikalen Ansichten über die Verwendung von Leichen nach Anweisung in den Untergrund gegangen ist. Keisei benutzt einen mit Leichenblut gefüllten Würfel als Schild, um Akasha vorübergehend zu besiegen, der sich daraufhin zurückzieht. Der gesamte Kougun-Kult ist schockiert, als er erfährt, dass Akasha wieder aufgetaucht ist, während er über Pläne nachdenkt, Keisei wieder in die Gruppe aufzunehmen.

Ouri trifft auf einen ehemaligen Highschool-Schüler namens Mitsuyoshi, der sich nach dem Schulabbruch in eine Leiche mit telekinetischen Fähigkeiten verwandelt hat. Obwohl Makina und Minai eingreifen und versuchen, ihn zu töten, behindern Mitsuyoshis Fähigkeiten und seine Kampfkraft ihre Bemühungen, ihn zu überwältigen.

Minai besiegt die Leiche, Mitsuyoshi, mit etwas Hilfe. Nachdem er ihn getötet hat, wird Ouri sein Handy von Minai als "Beweismittel" weggenommen. Nach der Schule kaufen Minai und Ouri gemeinsam ein neues. Später wird Minais Vertragspriester von einer Gruppe von Schlägern getötet, was Minai zu einer normalen Leiche macht. Sie wird von anderen Shikabane Hime gejagt, kann aber mit Ouris Hilfe entkommen. Er nimmt sie mit in die Bar, in der er arbeitet, und sagt ihr, dass sie dort sicher sein wird. Dort wird ihr gesagt, dass sie als Shikabane Hime überleben kann, wenn sie einen Vertrag mit Ouri abschließt. Daraufhin bringt sie sich um (oder wird umgebracht) und sagt, dass sie Shuuji Isakis Shikabane Hime ist.

Makina rettet eine Gruppe von Schülern vor einer Leiche, insbesondere Kasuka (Spitzname Omune-sama), ein Mädchen, das später in Makinas Schönheit des Todes vernarrt ist. Später untersucht Ouri, was mit Minai von Makina passiert ist, ohne Erfolg. Neugierig über Ouris Gefühllosigkeit gegenüber dem Tod, wendet sich Makina an Keisei und fragt ihn, warum er den Shikabane gegenüber so mitfühlend ist. Keisei zeigt uns eine Rückblende von Ouris erstem Auftritt im Waisenhaus, wo wir einen emotionslosen 3-jährigen Ouri sehen. Er hatte sich von der Welt abgekapselt, bis er ein weinendes Kätzchen am Flussbett rettete. Auf tragische Weise starb das Kätzchen kurz darauf bei einem Autounfall. Ouri, der von diesem Vorfall betroffen ist, ist sich des Todes ständig bewusst. Kasuka besucht Makina und schimpft über Ouri, weil er Makina nicht so gut kennen würde wie sie. Makina verteidigt ihn, indem sie behauptet, er wisse mehr über sie (den Tod) als Kasuka jemals wissen wird.

Keisei erfährt, dass Minai tot ist, nachdem sie von einem Rechnungsprüfer getötet wurde, was ihn wundert, da Ouri sie versteckt hat. Er eilt aus dem Krankenhaus zu seinem Vorgesetzten, Bischof Gon, um ihn zur Rede zu stellen. Danach wird Ouri von Kasuka gerufen, um sich eine Zeitschrift anzusehen, in der eine Sekte mit Anhängern beschrieben wird, die sich regenerieren, nachdem sie lebendig verbrannt wurden. In dem Glauben, dass diese Sekte etwas mit den Shikabane zu tun hat, besucht Ouri diese Sekte, um festzustellen, dass es sich um einen Schwindel handelt. Nach Ouris Abreise wird der Sektenführer von Sieben Leichen besucht, die sich selbst Skikusei Hokuto nennen. Er wird von Hokuto, dem Anführer der Shichisei Hokuto, getötet. Die Gruppe wird von dem Kougon-Verräter Akasha kontaktiert, um die Vernichtung der Kougon-Shikabane-Sekte Shouhouha zu planen. In der Zwischenzeit spürt Keisei den Rechnungsprüfer von Ouris Teilzeitjob auf.

Die Kouganer entdecken anhand von Überwachungsvideos, dass sich Hokuto in der Gegend aufhält. Mr. Aragami gibt die Information an Keisei weiter, woraufhin Makina zittert und versucht, ihre Aufregung und ihren Ärger unter Kontrolle zu halten. Ouri ist vorerst zurück im Waisenhaus, da er arbeitslos ist. Keisei erzählt Ouri, wie er in seiner Vergangenheit von Makinas Vater aufgezogen wurde und warum er den Pakt geschlossen hat, ein Vertragspriester zu werden. Der Shichisei Hokuto, Ena-san macht seinen Zug und zielt auf Ouri ab, indem er ihn in Besitz nimmt. Der buddhistische Leichnam von Shikusei Kowaku und der Verräter Asaka greifen Keisei und Makina auf dem Tempelgelände an. Asaka flieht und Keisei verfolgt ihn. Während er sich um die Sicherheit der Waisenkinder kümmert, wird Keisei von dem besessenen Ouri niedergestochen.

Keisei wird später schwerer verwundet und stirbt, nachdem er seinen Vertrag mit Makina auf Ouri übertragen hat. Makina schafft es, Shichisei Kowaku zu besiegen, während sie mit Ouri kämpft.

Die Beerdigung von Keisei wird gefeiert und Ouri beschließt, Priester zu werden, denn das Einzige, was seinem Bruder geblieben ist, ist Makina. Er begreift, dass die Nacht, in der Keisei starb, sein Leben für immer verändert hat...