Um príncipe exilado com uma identidade falsa é aprisionado por uma milícia, mas escapa com a ajuda de uma rapariga que lhe confere poderes especiais.

Lelouch entra em contacto com Kallen, uma das terroristas que apareceu em Shinjuku e põe-na em segurança, longe do exército da Britânia.

Lelouch investiga a morte da mãe. De volta à escola, descobre algo acerca de um colega e do seu poder especial. Suzaku é preso por homicídio.

Suzaku é incriminado por homicídio como pretexto para o exército expulsar honorários de Britannia. Lelouch ajuda-o a escapar e tenta recrutá-lo como rebelde.

A rapariga de cabelos verdes muda-se para casa de Lelouch. Já absolvido, Suzaku mostra à princesa Euphemia a cidade de Shinjuku, onde os dois impedem um assassinato.

Lelouch recorda o último encontro com o pai antes de ter sido exilado. Quando Cornelia monta uma armadilha para desmascarar Zero, Lelouch decide criar o seu exército.

Quando um hotel e os seus hóspedes são tomados por um grupo terrorista japonês, Lelouch monta uma operação de resgate e proclama a formação dos Cavaleiros Negros.

Os Cavaleiros Negros viram as atenções para um cartel que produz uma droga popular e perigosa, uma batalha que é particularmente pessoal para Kallen.

Lelouch e os seus Cavaleiros perseguem Cornelia e o exército dela até à sede da Frente, onde Kallen faz uso do seu novo Knightmare para causar uma derrocada.

Quando os Cavaleiros Negros tomam Narita, Euphemia ordena a Suzaku que salve Cornelia, o que deixa Lelouch preso entre três frentes de batalha.

Zero e o seu círculo interno encontram-se com um membro importante do submundo japonês. Em Tóquio, Shirley Fenette informa Zero de uma importante baixa na guerra.

Villetta insta Shirley a seguir os movimentos de Lelouch em segredo. Lelouch destrói um cargueiro e vê de seguida a vida em risco.

Lelouch segue Shirley até Narita, onde descobre Viletta, ferida. A força por detrás do ataque de Shirley a Lelouch é revelada.

Villetta acorda com amnésia parcial. Quando C.C. cede aos jogos mentais de Mao, Lelouch vai em seu auxílio, jurando não permitir que os seus poderes o escravizem.

Milly conhece o futuro marido. Quando Mao rapta Nunnally, Lelouch e Suzaku unem forças para a salvar e C.C. lida com Mao.

Um museu de arte é inaugurado em memória de Clovis. Lelouch recruta um novo Cavaleiro Negro a tempo de uma batalha com Lancelot que causa choque.

Suzaku torna-se cavaleiro de Euphemia. Lelouch parte para capturar Suzaku e o Lancelot, mas o comandante de uma nave de guerra de Britannia tem outros planos.

Na ilha Kamine, identidades secretas são desmascaradas e ruínas antigas ocultam uma armadilha. A Federação Chinesa ajuda os japoneses exilados a executarem um ataque.

Os invasores deparam-se com resistência do exército de Britannia. Nina fortalece inadvertidamente Euphemia. C.C. e Zero acorrem a Suzaku na batalha.

Ohgi, Villetta, Euphemia e Kallen ocultam as suas identidades no festival da escola, mas quando a de Euphemia é revelada, ela faz uma proclamação fatídica.

Uma discussão sobre o futuro do Japão corre mal quando os poderes de Lelouch se descontrolam e ele envia Euphemia na rota de um massacre impensável.

Euphemia tenta resistir ao Geass enquanto procura sobreviver. Zero anuncia o plano para a criação de uma nova nação, e começa uma nova revolução.

A Academia de Ashford é convertida em base para os Cavaleiros Negros, enquanto Suzaku os desafia. A memória de Viletta regressa. Lelouch defronta Cornelia.

Lelouch descobre o que Cornelia realmente sabe sobre o homicídio da mãe. Lelouch vai até à ilha Lamine para salvar Nunnally e tem um derradeiro confronto com Suzaku.