Um ano se passou desde a Rebelião Negra, uma insurreição fracassada contra o Império Britânico, liderada pelo vigilante mascarado Zero, que agora está desaparecido. Sem o seu líder revolucionário, o grupo de resistência da Área 11 - os Cavaleiros Negros - se vê impotente demais para combater a brutalidade infligida aos Elevens pela Britannia, que aumentou significativamente a fim de esmagar qualquer esperança de uma futura revolta. Lelouch Lamperouge, tendo perdido toda a memória de sua vida dupla, está vivendo pacificamente ao lado de seus amigos como estudante do ensino médio na Ashford Academy. Sua ex-companheira C.C., incapaz de aceitar essa reviravolta dos acontecimentos, se encarrega de lembrá-lo de seu propósito passado, esperando que o mentor Zero ressuscite mais uma vez para terminar o que começou, nesta emocionante conclusão da série.