Les filles sont sous le choc de la fusillade durant laquelle "A" a tiré sur Ezra qui est emmené d'urgence au bloc opératoire mais "A" garde un œil sur Ezra qui connaît son identité. Les filles tentent donc d'éloigner "A" d'Ezra. Mélissa est sous le choc d'apprendre que Alison est vivante mais Veronica est persuadée que Mélissa et Peter cachent quelque chose. "A" tombe dans le piège des filles mais celles-ci se retrouvent à leur tour encerclées par des personnes portant des sweats à capuche noir mais la police intervient pour disperser tout le monde. Alison emmène les filles au Théâtre Fitzgerald et où l'on revoit qu'Ezra est riche. Alors que les filles s'endorment, Alison et Cece en profitent pour se retrouver alors que pendant ce temps, Mona s'allie à plusieurs personnes que Alison maltraitait du temps où elle était à Rosewood comme Lucas et Paige. Au théâtre, alors que les filles s’apprêtaient à partir, les lumières s'éteignent et "A" arrive et il s'agit de Shana qui révèle que c'est elle qui a tiré sur Ezra et que c'est elle qui a mis le feu à Thornhill. Alison comprend donc que Shana en veut aux filles car ce sont elles qui ont rendu celle qu'elle aimait aveugle en l’occurrence : Jenna. Alors que Shana s'apprête à tirer sur Alison, Aria l'attaque dans le dos et fait chuter Shana de la scène et elle meurt car elle s'est cognée la tête en chutant. À la fin de l'épisode, la police arrive au théâtre Fitzgerald et ils découvrent le corps de Shana, gisant au sol, morte.

Les filles retournent à Rosewood à la suite des événements de New York. Aria culpabilise sur le fait qu'elle ait tué Shana. Mona n'est pas ravie du retour d'Alison et le lui fait comprendre en lui envoyant un message anonyme. Toby revient de Londres et révèle à Spencer que Melissa n'était pas là au moment où il la cherchait. Hanna et Emily sont méfiantes à propos de Jason et de la relation qu'il entretient avec sa mère, c'est pourquoi elles décident de le suivre jusqu'à Philadelphie pour trouver des réponses. Alison est forcée de rester chez elle, mais elle ne fait pas confiance aux membres de sa famille. Le chien d'Alison découvre plus tard un corps enterré en face de sa maison, il s'agit du corps de sa mère : Jessica DiLaurentis.

Après avoir appris la mort de sa mère, les filles tentent de réconforter Alison, mais sans succès. Aria refuse d'abord de parler à Ezra, qui est de retour à Rosewood mais elle accepte plus tard, elle lui révèle alors qu'elle a tué Shana. Emily et Paige accueillent une nouvelle fille dans l'équipe de natation : Sydney. Pendant ce temps, Spencer essaie de comprendre Jason et son implication dans la mort de Mme DiLaurentis mais celui-ci met en garde sa demi-sœur en lui disant de ne pas faire confiance à leur père. Melissa et M. Hastings sont persuadés que c'est bel et bien Jason qui a tué sa mère. Dans la scène finale, Hanna est dans un salon de coiffure et on voit Mona avec une autre femme derrière la vitre en verre dépoli.

Alors que Spencer est persuadée que sa sœur et son père lui cachent des choses, elle choisit de se confier à sa mère qui ne veut rien lui dévoiler de ses soupçons mais elle reconnaît que Peter pourrait être derrière le meurtre de Mrs.Dilaurentis du fait que celle-ci a toujours soupçonné Spencer d'être la cause de la disparition d'Alison.

Alison subit un examen médical et une cicatrice attire l'attention du médecin. Hanna souhaite en savoir plus à propos de cette cicatrice mais Alison ne dit rien.

Aria, quant à elle, se noie dans sa culpabilité concernant la mort de Shana, elle regarde en boucle la vidéo de l'enterrement de Shana et finit par se réfugier chez Ezra pour obtenir du soutien.

Hanna vole un vêtement. Spencer trouve par hasard le Losartan.

Le retour d'Alison au lycée de Rosewood est enfin arrivé. Elle revient au lycée avec l'intention de s'excuser auprès des personnes à qui elle a fait du mal.

Mona prépare son "armée de perdants" afin de mener la vie dure à Alison.

La police annonce, au cours d'une conférence de presse, que la jeune fille morte dans la tombe d'Alison s'appelle Bethany Young. Hanna rencontre Caleb. Aria propose à Jenna de l'écouter. Hanna annonce à sa mère que Caleb est revenu. On voit Aria et Ezra s'embrasser et Emily et Alison aussi.

A fait son retour à Rosewood et provoque une explosion laissant les menteuses et leurs amis plus choqués que jamais.

À la suite de l'explosion de la maison de Toby, les menteuses se demandent alors qu'elle était la raison de cet acte. Alison regrette d'être revenue à Rosewood en apprenant le retour de "A", elle envisage de quitter la ville. Mais Aria, Emily et Spencer sont déterminées à la retenir et assurer sa sécurité. En revanche, Hanna ne la retient pas et promet de l'aider. Cette dernière a changé depuis le retour d'Alison, et le retour de Caleb n'a rien arrangé, son comportement déplaît à Travis qui décide de rompre.

Aria commence son travail de bénévole à Radley et elle tombe sur l'ancienne colocataire de Bethany Young en l’occurrence Rhonda. Puit elle découvre une mystérieuse crotte dans une chambre de Raddley

L'inspecteur Tanner doute de plus en plus de la véracité des témoignages d'Alison. Hanna qui tente d'éviter Alison sombre dans l'alcool et se retrouve dans une situation délicate lorsque Zack la drague. Aria progresse dans son enquête car elle apprend grâce à Rhonda que Mrs. Dilaurentis avait une relation privilégiée avec Bethany Young. Alison a demandé à Noël Kahn de se faire passer pour A afin que les gens croient à son histoire de kidnapping.

Spencer va chez le médecin pour se faire soigner les yeux et voit Sydney tenant la main de Jenna. Spencer appelle Emily et lui dit qu'elles ressemblent à des jumelles parce que les deux portent les mêmes vêtements et lunettes. Sydney dit à Emily qu'elle connaissait Jenna depuis plusieurs années.

Alison ne sait pas si elle doit identifier Cyrus Petrillo comme étant son ravisseur, de peur que ce soit un pière de -A. Le détective Tanner emmène Alison dans une maison abandonnée pour qu'elle puisse se souvenir des événements passés. Tanner dit à Alison que si elle ne se souvient pas de Cyrus comme étant son ravisseur, celui-ci sera relâché et libre.

Les Liars reçoivent un message surprise de "A" sur un téléviseur alors qu'elles sont dans les rues de Rosewood. Hanna, Spencer et Toby veulent aider Caleb après avoir exprimé une véritable inquiétude à son sujet du fait qu'il soit accro à l'alcool. Tanner interroge les Liars et leur demande si l'une d'entre elles sait qui a tué Bethany Young, impliquant implicitement qu'elle les suspecte.

A Halloween-themed ode to viewers features interviews with cast and crew, fan questions and visits from dearly departed characters.

The girls are not feeling merry at Christmas because Spencer's murder charge looms over them. Things improve though after they see an opportunity to gather evidence to clear her name.

The Liars try to prove that Alison was involved in Mona's death; Aria worries about her future.

Spencer and Toby are at odds while Emily and Aria struggle with situations that are out of their control.

Secrets abound for Aria, Hanna and Spencer while Emily tries to let go of Paige.

Hanna refuses to let "A" frame her for Mona's murder; Spencer's actions put Toby in a bind.

Leslie, une ancienne amie de Mona est à la recherche de Hanna. Elle veut surtout remercier les Liars d'avoir été présentes pour Mona et sa mère. Hanna récupère une cassette qui se trouvait dans un livre dans la chambre de Mona. Sur l'enregistrement, on entend Bethany Young qui semble en vouloir à quelqu'un. Aria cherche à savoir la raison pour laquelle Mike rend visite à Alison en prison, Emily passe du bon temps avec Talia tout comme Spencer avec Jonny et Holbrook revient à Rosewood.

À la collecte de sang de l'école dirigée par Ashley, Mike adopte un comportement suspect lorsque les filles pensent qu'il a volé des échantillons de leur sang. Emily et Talia se confient sur leurs plus grands secrets, mais Emily est choquée d'apprendre que Talia est mariée. Hanna découvre qu'un accord financier entre ses parents ne lui permettra pas d'aller à l'université à laquelle elle aspirait d'autant plus que sa mère est maintenant sans emploi. Ashley a accepté d'épouser Ted mais elle lui a révélé son aventure avec Jason mais Ted n'est pas prêt à lui pardonner. Johnny demande l'aide de Spencer pour créer une peinture murale à l'université d'Hollis et en même temps, il compte réveiller l'artiste qui sommeille en elle.

Déterminée à entrer à l'université et à financer ses études, Hanna s'est inscrite et s'entraîne au concours de beauté pour remporter 20 000 $. Emily devient le temps d'un instant sa professeur de danse pour l'aider à trouver un talent. Spencer a pardonné depuis Johnny pour l'histoire de la peinture à fresque d'Hollis, mais quand ils découvrent que leur «vandalisme» a été mis en vente dans une galerie sans leur permission, ils veulent récupérer leur bien. Emily et Talia essaient de garder leur relation secrète, mais Emily est blessée quand elle découvre que Talia a dit à son mari Eric que leur relation n'est qu'une expérience. Aria soupçonne Mike et commence à croire qu'il pourrait avoir un lien avec la mort de Mona.

Spencer, Aria et Emily rendent visite à Alison en prison. Alison met en garde Aria sur le fait que Mike pourrait devenir une cible de "A". Spencer part à Londres car elle a un entretien à l'université d'Oxford. En arrivant sur place, elle est accueillie par Colin, le colocataire de Wren et sa sœur Melissa. Aria sait où se trouve Cyrus, les deux Liars se rendent donc à l'hôpital pour obtenir des informations sur "A" de la part de Cyrus. Lors de la visite, Cyrus blessé n'arrive pas à parler mais il réussit à marquer sur un papier "Carjack".

La date du procès d'Alison se rapproche, les choses deviennent tendues et Alison commence à se sentir en danger en prison. Emily et Aria allient leurs forces avec Ezra pour savoir qui est le mystérieux Varjack en interrogeant l'avocat de Mona, James Nielan. Les trois suivent Nielan qui va dans une grande maison gardée dans les bois et Emily trouve un reçu qui pourrait les aider à découvrir qui est Varjack. La police découvre que le sang de Hanna se trouve sur les vêtements que portait Mona le jour de sa mort. Hanna est arrêtée et emmenée en prison.

Le procès d'Alison commence par le procureur qui rappelle les faits. Lorsque Jason est appelé à témoigner, sa liaison avec Ashley est révélée aux yeux de tous. Le procureur pense que Jason a changé sa version des faits sous l'influence d'Ashley pour protéger Hanna. Spencer découvre que le numéro de téléphone de Varjak est le même que celui qui est dans les petites annonces dans la maison de Alison. Lorsque Hanna interroge Alison sur ce sujet, elle révèle que les messages venant de ce numéro ont commencé après que le corps de sa mère a été trouvé et elle pense que c'était Mona qui envoyait les messages car ceux-ci ont cessé quand elle a été assassinée. Aria reçoit un appel venant du numéro de Varjak et quand Caleb décroche, on entend une chanson française qui était une des chansons préférées de Mona. Spencer, Emily et Aria se rendent à la maison de Mona et découvrent que sa chambre a été fouillée par «A», elles trouvent un indice caché dans un miroir.

Le procès d'Alison continue. Leslie, l'amie de Mona est entendue comme témoin lors du procès. Elle accuse Alison du meurtre de Mona. Spencer, Emily et Aria tentent de trouver un témoin qui aurait vu Alison le jour du meurtre de Mona. Mike veut être entendu en tant que témoin et raconter tout ce qu'il sait pour que tout le monde sache enfin la vérité à propos de "A". Plus tard, Mike se fait attaquer. Le verdict du procès est prononcé et Alison est reconnue coupable du meurtre de Mona.

Les quatre filles sont enlevées par « A » et conduites dans une maison de poupées géantes, à l'effigie de leur chambre respective. Pendant qu'elles essaient de s'échapper tout en participant au jeu de "A" pour sauver leur vie, elles découvrent que Mona n'est pas morte et bel et bien en vie, mais qui sous les ordres de "A" fait semblant d'être Alison. Les 5 filles essayent désespérément de trouver une sortie. Caleb, Toby, Ezra et les parents de Spencer s'allient pour retrouver les filles. Finalement, Tanner découvre le repaire de « A » grâce à l'aide de Caleb. Spencer découvre que "A" n'est autre que Charles DiLaurentis. Les filles tendent un piège à « A » mais se retrouvent coincées dehors, enfermées par une clôture électrique.