Frank gerät in Verlegenheit, als ein Unterstützer des Bürgermeisters tot aufgefunden wird und der Bürgermeister möchte, dass Frank es als zufälligen Gewaltakt gegenüber der Öffentlichkeit darstellt. Unterdessen führt Jamie seinen ersten Undercover-Einsatz in einer Bar durch, wo er einen verdächtigen Gast trifft und Kontakte knüpft.

Als Danny nach einem Vorfall, bei dem ein Polizist, der sich nicht ausweisen konnte, erschossen wurde, einen geänderten Auftrag erhält, muss er sich mit Ermittlern des Innenministeriums auseinandersetzen, die seinen Geisteszustand an diesem Tag auf weitere Konsequenzen prüfen.

Drei Männer versuchen, eine Bank auszurauben, und Danny findet heraus, dass einer der versuchten Räuber ein ehemaliger Polizist ist. Außerdem arbeitet Jamie mit Luisa Sosa, seiner neuen Partnerin, zusammen.

Erin muss einen 18 Jahre alten Vergewaltigungsfall neu aufrollen, in dem Frank der festnehmende Beamte war. Danny und Jackie müssen sich mit dem Mord an drei Teenagern auseinandersetzen, für den es offenbar kein Motiv gibt.

Während er an einem Fall arbeitet, versucht Danny, ein romantisches Wochenende mit Linda zu verbringen. Jamies Undercover-Auftrag betrifft eine kriminelle Familie.

Frank kämpft mit einer politischen Krise, nachdem Jamie und Renzulli von einem Sicherheitsteam der Kirche verletzt werden, das ihnen aufgrund eines Notrufs den Zutritt zu einem religiösen Zentrum verweigert.

Jackie wird als Eskorte verdeckt, als sie und Danny einen Serienmörder aufspüren, der Prostituierte in Hotelzimmern ermordet. Unterdessen trifft Erin in einer Kunstgalerie einen potenziellen Bewerber, der ihre Interessen teilt.

Henrys Herzinfarkt am Vorabend von Thanksgiving lässt die Familie über eine Zukunft ohne ihn nachdenken. Während Danny und Jackie einen Selbstmord untersuchen, der möglicherweise nicht das ist, was er zu sein scheint, sind sich Frank und der Bürgermeister nicht einig über eine Bedrohung für die Stadt.

Danny begleitet einen gefährlichen Ex-Gangster, der ihm hilft, Leichen in ungelösten Fällen zu finden, als Gegenleistung für Nachsicht für seinen Sohn bei einem schweren Autodiebstahl. Währenddessen arbeitet Jamie verdeckt in einem Heizungskeller auf der Suche nach einem Geheimnis über die Familie Sanfino.

Als Erins Informant ermordet wird, gibt sie sich selbst die Schuld und hilft Danny dabei, herauszufinden, wer ihn getötet hat.

Danny und Jackie untersuchen einen Tatort in einem Restaurant, wo ein Zeuge behauptet, ein uniformierter Beamter sei vom Tatort geflohen, nachdem Schüsse abgefeuert worden seien.

Auf dem Heimweg mit seiner Familie überfährt Danny mit seinem Auto einen Mann, der vor einem Schützen flieht, und seine Familie gerät ins Kreuzfeuer, als Danny mit seiner Waffe auf den Schützen feuert. Frank muss sich mit der Schuld am 11. September auseinandersetzen, die auf den drohenden Verlust eines Freundes zurückzuführen ist, mit dem er am Ground Zero zusammengearbeitet hat.

Als eine reiche Frau an einem Herzinfarkt stirbt, behauptet ihre exzentrische Tochter, sie habe eine Botschaft von Gott erhalten, der ihr sagte, dass ihr Stiefvater sie tatsächlich ermordet habe. Unterdessen möchte der Erzbischof Franks Unterstützung für die Heiligsprechung eines örtlichen Priesters, doch ein widerstrebender Frank nimmt es auf sich, einem Gerücht nachzugehen, dass der Priester bei seinem Protest gegen den Vietnamkrieg zu weit gegangen sei.

Danny und Jackie untersuchen den Mord an einem Freund der Reagan-Familie, der als verdeckter Ermittler tätig war. Dannys Familie beginnt sich Sorgen zu machen, da die anhaltende Suche einen emotionalen Tribut von ihm fordert.

Als Franks enger Freund, ein hochkarätiger Reporter, beinahe angegriffen wird, während er in der Stadt eine Geschichte recherchiert, versuchen Danny und Jackie, ihren potenziellen Angreifer aufzuspüren. Unterdessen spitzt sich Jamies Undercover-Fall zu.

Während Erin eine Frau strafrechtlich verfolgt, die beschuldigt wird, ihren Ehemann getötet zu haben, wird der Anwalt des Angeklagten ermordet und Danny mit den Ermittlungen beauftragt. Als Danny zum Verhör vor Gericht gestellt wird, kommt es zwischen den Geschwistern zu hitzigen Auseinandersetzungen.

Danny gerät in eine schwierige Lage, als eine Waffe, die mit einem Raubüberfall in Verbindung steht, in das Waffenrückkaufprogramm des NYPD aufgenommen wird. Er muss sich entscheiden, entweder den Verdächtigen festzunehmen oder der Regel zu folgen, keine Fragen zu stellen.

Danny sorgt in der Abteilung für Aufsehen, als er auf Drängen des 12-jährigen Sohnes des Mannes einen abgeschlossenen Fall untersucht, den Selbstmord eines Feuerwehrmanns. Währenddessen rettet Jamie ein Baby aus einem brennenden Gebäude, befürchtet jedoch, dass dies seine Undercover-Arbeit gefährden könnte, als ihm in der Presse ein Held angepriesen wird.

Danny und Jackie werden damit beauftragt, eine wichtige Zeugin in einem russischen Mafia-Prozess zu beschützen, doch als ein Attentat auf sie verübt wird, stellen sie fest, dass es in der Task Force eine Lücke gibt. Unterdessen wird Erin ein Job als stellvertretende Bürgermeisterin angeboten, bei dem sie direkt mit ihrem Vater zusammenarbeiten würde.

Danny und Jackie untersuchen den verdächtigen Mord an einem hochkarätigen Investor, der durch einen Kampf Verletzungen, aber keine Spuren an den Händen hatte. Währenddessen stellt Frank Jamie unter Hausarrest, als die Familie Sanfino einen Hit auf „Jimmy Reardon“ herausbrachte.

Frank muss darum kämpfen, einen Angriff mit biologischen Waffen auf New York City zu stoppen, während er ihn während ihres sentimentalen Feiertags, dem Muttertag, vor seiner Familie geheim halten muss. Unterdessen spitzt sich ein langjähriger Konflikt zwischen Danny und Jamie zu.