Po dziesięciu miesiącach od zamieszek, Em City zostaje ponownie otwarte. McManus tworzy rady przedstawicieli grup, by utrzymać porządek. Pojawia się pomysł wprowadzenia zajęć, które pomagają więźniom uzyskać lepsze wykształcenie.

Alvarez wie, kto zgwałcił córkę Glynna, ale odmawia współpracy z jednym ze strażników. Wangler robi postępy w szkole, ale jego sąsiad – Adebisi nie jest w stanie zrozumieć, dlaczego to takie ważne. Sprawa z przyjmowaniem łapówek powoli się wyjaśnia.

Podczas jednej z bójek dochodzi do tragicznego wypadku. Więzień zostaje przesłuchany i oskarżony o morderstwo, jednak wyjawienie pewnych tajemnic może zmienić bieg wydarzeń. Osoba orzekająca w Sądzie Stanowym zostaje posądzona o branie łapówek.

W więzieniu dochodzi do przepychanek, jednak reakcja pracowników Oz jest natychmiastowa. Telewizja zaczyna interesować się sprawami zakładu karnego. Skazani dostają publiczną pochwałę za zaangażowanie w naukę.

Sprawa Schillingera wygląda na mocno skomplikowaną. Okazuje się, że jeden ze skazańców został zgwałcony, jednak nie chce o tym rozmawiać. Wojna między więźniami może wybuchnąć w każdej chwili.

Cyril O'Reily, brat Ryana zostaje uwięziony i trafia pod opiekę Schillingera. El Cid mówi Alvarezowi, że jest w stanie pozostać w grze. Między więźniami dochodzi do słownych potyczek.

W finale drugiego sezonu Wittlesey zostaje przeniesiony i zastąpiony przez nazistowskiego Karla Metzgera. Mack i inny Aryjczyk próbują uciec. Hill wpada na pomysł ukrycia się w trumnie, by opuścić mury Oz.