Cette série raconte l'histoire d'un jeune garçon, Jake Long, qui descend par sa mère d'une famille de dragons. En conséquence, il a lui-même hérité de la faculté de se transformer à volonté, partiellement ou entièrement, en un dragon, avec toutes les capacités liées à la créature. Son grand-père maternel et sa sœur possèdent eux aussi cette faculté, contrairement à son père, qui ignore que sa famille est principalement composée de reptiles magiques, et à sa mère (pour laquelle les pouvoirs de dragons ont sauté une génération), qui en revanche le sait et cherche à le cacher à son mari.

En tant que Dragon, Jake a pour rôle de défendre son territoire (entre autres, l'Amérique) et toutes les créatures magiques qui y vivent secrètement contre d'éventuelles menaces, notamment des chasseurs (dont certaine d'entre eux est Rose, la petite amie de Jake). Il est à cette fin entraîné par son grand-père.