Black Jack es un médico 'no registrado' con un pasado misterioso y nublado. Trabaja con su pequeña asistente Pinoko (que está enormemente enamorada del médico), ocupándose de casos médicos no muy conocidos, que pueden ser extraños, peligrosos o desconocidos en absoluto. Pero es un genio y puede salvar casi cualquier vida de sus pacientes (siempre que tengan el dinero para ello, claro está), y es conocido por muchos en todo el mundo, especialmente entre los de la medicina y la ciencia. Él mismo es un hombre de ciencia y no cree mucho hasta que lo ha visto, sin embargo, muchas veces se sorprende cuando el amor y la naturaleza a menudo dominan la ciencia en la que basa su vida.

Black Jack intenta averiguar la conspiración, de por qué estuvo involucrado en el accidente del campo de bombas que mató a su madre, mientras descubre secretos de Organización y Proyecto "Noir", en el que estuvieron involucrados su padre y otros médicos famosos.

Black Jack alias Kuroo Hazama gilt als der beste Chirurg der Welt. Obwohl er keine Lizenz zum Praktizieren besitzt, genießt er einen ausgezeichneten Ruf und schafft es selbst die kompliziertesten und mysteriösesten Fälle zu lösen. Doch das hat seinen Preis...

Black Jack is an "unregistered" doctor with a clouded, mysterious past. He works with his little assistant Pinoko (who has a massive crush on the doctor), dealing with medical cases not very well known, which can be strange, dangerous, or not known at all. But he is a genius, and can save almost any of his patients' life (as long as they have the money for it, that is), and is known to many around the world, especially to those of medicine and science. He's a man of science himself, and does not believe much until he has seen it, yet it is many times he is surprised by love and nature often overpowering the science he bases his life in.

Сиквел, не имеющий прямого отношения к оригинальному сюжету. Чёрный Джек пытается узнать причины взрыва, убившего его мать и тяжело ранившего его самого, постепенно раскрывая секреты таинственной преступной организации и проекта «Нуар», в который его отец и другие знаменитые врачи когда-то были вовлечены.

"Black Jack" est une légende dans le monde médical. Célèbre pour être l'un des meilleurs, ainsi que pour ne pas avoir de licence, Black Jack sauve d'innombrables vies alors que les autres médecins abandonnent... moyennant un prix exorbitant. Beaucoup le considèrent comme avide et sans cœur. Mais malgré ces affirmations, il risque sa vie pour soigner certaines des maladies les plus étranges qu'on puisse imaginer, même si cela implique de violer toutes les lois.

世界著名的制药公司戴达罗斯的巨大高楼被神秘组织装置了炸药而爆炸，大楼周围成为一片地狱的景象。一个少年被铁骨夹住，身受重伤，救助队束手无策，而那块铁骨有随时会崩落的危险。此时，B.J(Black Jack)出现，以他无执照行医行为的无罪为条件帮忙救援，进行了一场谁都无法想想的“外科手术”。 巨大高楼的爆破卷起了更大的悲剧，一个母亲由于爆破事故被诊断为一生都无法恢复，兄妹两人为了请B.J作手术而到处打工，但是他们所赚的远不可能达到B.J平时的酬金。看着如此拼命的兄妹，B.J联想到了因为事故失去母亲，过去的自己。另一方，不想影响自己孩子未来的母亲悲观的态度引来了“死神的化身”Dr.Kiriko。死神将坐下怎么样的判决呢……

神秘组织所设的毁灭人类计划“撒旦”、被阴谋笼罩的神秘的岛屿“伊卡罗斯岛”、Dr.Kiriko以“生命”为赌注的对决。以一把手术刀创造奇迹的天才外科医Black Jack面临着系列史上最大的危机。 没有行医执照的天才外科医，以他的手术刀创造了无数的奇迹。但是因为以生命为代价收取高额的治疗费，被称为恶德医师。不畏任何权威，遵从自己的信念。

黑傑克本名間黑男，從小父親因婚外情而私奔及離棄他及母親，因此和母親一起生活。某日與母親出遊，因工程商的人為疏失，他誤觸未爆彈引發爆炸，母親送醫後不治，他也一度瀕死，但終於被擁有高明醫術的本間丈太郎醫師救活。痛苦的復健過程中，使他活下去的動力只有兩個：成為和本間醫師一樣的一流外科醫師，以及報復害死母親的工程商關係人。若干年後，間黑男果真習得世界頂尖的外科技術，不過由於對醫學的理念不見容於醫學界，醫師執照被吊銷，但他仍憑其高超的醫術自己開診所，並向病患收取鉅額手術費。人們稱這位無照行醫的外科天才為：黑傑克。

映画、ＯＶＡ、実写のＴＶドラマなど、さまざまな形で映像化されてきた人気作『ブラック・ジャック』の、初のＴＶアニメシリーズ。

基本的に原作に忠実な作りだが、幅広い層の視聴者に受け入れられるよう、手術シーンの描写やストーリー展開にアレンジが加えられている。

また、飼い犬のラルゴや、「三つ目がとおる」の写楽や和登千代子が、シリーズのレギュラーキャラクターとして追加された。

신이라 칭송받는 수술 솜씨로 기적을 일으키는 생명의 예술가. 시대가 낳은 천재 외과 의사 블랙 잭.