Az USA-ban nukleáris robbanások történnek. Jericho lakói nem is sejtik, hogy milyen veszély közeleg. Denver irányában egy gombafelhő utal arra, hogy robbanás történt. Majd hirtelen mindenütt elmegy az áram, és megszakad a kapcsolat a lakosok és a modern világ között. Közben egy iskolabusz elvész, és előkerül egy rabszállító autó.

Nem sokkal a nukleáris bomba után Jake rohan, hogy figyelmeztesse Jericho város lakóit egy újabb veszélyre: a Denver felől érkező esőre. Hogy megmentsék az embereket egy esetleges radioaktív sugárzástól, mindenkit a föld alá visznek egy biztonságos bunkerbe, amikor is kiderül, hogy ott azonban nincs elég hely számukra.

Jake úgy dönt, hogy csapatokat szervez a város lakóiból, hogy közös erővel derítsék ki, mi is történhetett Jericho-n kívül. Rövid időre sikerül a műholdvevőknek információhoz jutni, melyből lassan szinte biztossá válik, hogy az Egyesült Államokat több ponton is támadás érte.

Jake és Heather idegen eredetű, radioaktív anyaggal megmérgezett férfira bukkannak az út mentén. Azonnal kórházba szállítják, majd megpróbálnak belőle minél több információt kiszedni a történtekről. Eközben persze a város lakóinak egy újabb nehézséggel kell szembenézniük.

Jericho lakossága üzenetet kap a Nemzetvédelemtől, miszerint már a város felé tart a segítség. Ráadásul időközben az áram is visszatér, ezért mindenki azt feltételezi, hogy rövidesen újra a régi életüket élhetik. Ám a városszerte leszakadt villamosvezetékek többsége tüzet okoz, így Jake-nek Hawkins segítségével most éppen ezzel kell megküzdenie.

Jericho városa felett több kilőtt rakéta száll el, miközben a lakók egyenként kapnak üzenetet az Államszövetségi kormány megszűnéséről. Az emberek így ébrednek rá, hogy a robbanások óta egyedül vannak és kizárólag csak magukra számíthatnak. Ráadásul pontban 9:02-kor egy elektromágneses impulzus miatt az egész város sötétségbe borul.

Miközben Jericho lakói a Halloween-ra készülődnek, Gray Anderson visszatér, hogy elmesélje, milyen szörnyűségekkel szembesült a városon kívül. Gray azt is megtudta, hogy mely városokat ért támadás, és melyeket nem, ezért kötelességének érzi, hogy mindenkit tájékoztasson a látottakról. Ezalatt Jake pedig tárgyalni próbál a csapatának egyik őrizetbe vett tagjáért.

Johnston polgármester élete veszélybe kerül, amikor úgy tűnik, hogy az antibiotikum sem segít rajta. Jake és Eric, hogy megmentsék az apjukat, ezért egy közeli nagyvárosba, Rogue River-be utaznak egy erősebb hatású gyógyszerért. Amikor azonban megérkeznek, döbbenten veszik tudomásul, hogy a világ óriásit változott: a kórház ugyanis tele van lemészárolt emberekkel.

Miközben Jake és Eric azon aggódnak, hogy Ravenwood csapata nehogy megtalálja Jake pénztárcáját a pontos címmel együtt, addig a város négy órát kap arra, hogy megtisztítsa a Jericho felé vezető utat. A súlyos következményektől tartva, Jake azt javasolja, hogy robbantsák fel a város hídját, ám ezzel nem értenek mindannyian egyet. Közben pedig elérkezik Emily esküvőjének napja.

Jericho városa felett repülők szállnak el, és ázsiai felirattal ellátott segélycsomagokat dobálnak le. A lakosság persze egyre türelmetlenebbül várja az élelmiszerek kiosztását, miközben a polgármester a csomagok tartalmát ellenőrzi. Egy generátor ezalatt éppen a Richmond farmon ér földet, Jonah pedig azonnal értesül az újonnan érkezett áramforrás híréről.

Ahogy közeledik a polgármester-választás időpontja, Gray egyre biztosabbá válik a dolgában. Amikor pedig holtan találják az egyik helyi boltost, a férfi azonnal Jonah-ra és a bandájára fogja az ügyet. Az egész városra kiterjedő nyomozást rendelnek el, miközben Jonah a lányánál, Emily-nél húzza meg magát. Jake pedig elhatározza, hogy az édesapja segítségével megvédi a férfit Gray vérszomjas embereitől.

Az atomrobbanás előtti 36 óra eseményeibe bepillantva végre feltárul Jake és Hawkins titokzatos múltja. Láthatjuk Jake-et, amint San Diegóban próbál új életet kezdeni kevés sikerrel. Hawkins még több rejtélyt tartogat; többek közt egy Sarah nevű nőhöz fűződő viszonya vet fel új kérdéseket. Emily vőlegénye, Roger is ekkor készülődik a chicagói állásinterjúra, de Emily egyáltalán nem lelkes a jövőbeli munka miatt és Jericho jelenében most Roger és Sarah is felbukkant.

Különleges pillanatoknak lehetünk szemtanúi, amikor betekintést nyerhetünk a város lakóinak életébe - 36 órával a becsapódás előtt. Jake éppen a családja elől bujkál San Diegóban. Emily és a vőlegénye, Roger között parázs vita alakul ki egy chicagói állásinterjú kapcsán. Eközben pedig Hawkins élete egyre bonyolultabbá válik.

Jericho városának mindennapi energia-készletei egyre csak fogynak, ráadásul a generátor sem bírja már sokáig. Heather egyetlen megoldásnak a szélmalmok beindítását látja, ám ahhoz bonyolult műszaki fejlesztések szükségesek. A tél közeledtével azonban a dolog egyre sürgetőbbé válik, ezért a Roger által említett Black Jack nevű piacra indulnak, hogy a hiányzó dolgokat beszerezzék.

Jericho lakói a kemény tél miatt vadászatra kénytelenek adni a fejüket. Ám mivel körülbelül 15 kilométeres körzetben nincs már élő állat, ezért távolabbra kell merészkedniük. Útközben azonban balesetet szenvednek, így Stanley és Jake súlyos és válságos állapotba kerül, miközben Mimi szerencsésen megússza az esetet, és segítségért indul.

A tengerészgyalogság csapata érkezik a városba, hogy segítsen végre talpra állni az embereknek. Ám először nekik van szükségük némi segítségre, ugyanis elromlott a rádióvevőjük. Jake hozzálát a javításhoz, miközben Maggie és Gray megvendégelik a katonákat, és úgy tűnik, hogy valami nagyon nincs rendben.

Kiderül, hogy April-nek nehéz terhességre kell felkészülnie, ráadásul nem sokkal később súlyos belső vérzés miatt operációra szorul. Végre megérkezik Jericho városába a rég várt szélmalom. Hawkins eközben megpróbálja eltűntetni Sarah Mason halálának nyomait. Mimi pedig ki szeretne békülni Bonnie-val.

Jimmy és Jake Hawkins házába mennek, hogy átkutassák a dolgait és végre kiderítsék, hogy valójában kicsoda is ő. Amikor azonban a férfi váratlanul hazatér, Jake pisztollyal a kezében kényszeríti vallomásra. Kiderül, hogy Hawkins és Sarah mindketten CIA ügynökök.

Végre előkerülnek a szélkerekek és a korábban eltűnt tíz ember is. Ám kiderül, hogy Eric nincs közöttük. Jake kétségbeesve kér segítséget Hawkins-tól, hogy együtt utazzanak vissza New Bernbe, Eric keresésére. Megérkezvén gyanússá válik a helyi gyár, melyről hamarosan megtudják, hogy fegyvereket gyártanak benne, hogy megtámadják Jerichot.

Jerichóban valósággal elszabadul a pokol, amikor a New Berniek elfoglalják a város létfontosságú építményeit, de legfőképpen a sóbányát. Ráadásul a lövöldözésben rengeteg a sérült. Eközben Hawkins Eric és Jake kiszabadításán ügyködik, melyben segítségére van Ted és Maggie is.

Miután Jake-nek és a többieknek sikerül épségben hazatérniük, küldönc érkezik New Bernből, és alkut ajánl Graynek. Ám mivel a város vezetése gondolkodási időt kér, ennek súlyos következményei lesznek. Johnston pedig csapatokat szervez, hogy megtalálják az aknavetőket.