בצדו הדרומי של יפן, ישנו אי ירוק הנקרא "אי הצלב הדרומי". לילה אחד, נער בשם טסונאשי טאקוטו נשטף על החוף של האי, לאחר ששחה מן היבשת לבדו ללא כל רכוש, שהגיע לאי בכדי לחפש את אביו שנטש אותו כאשר היה ילד קטן. נערה בשם הגמאקי וואקו מוצאת אותו בזמן שטיילה עם ידיד, שינדו סוגאטה, ומצילה את חייו. הוא נרשם לבית הספר הבכיר ברמה הגבוהה על האי, "תיכון הצלב הדרומי", בית הספר שבו נמצאים וואקו וסוגאטה. קרוב מאוד לבית הספר, ישנו מקום חשוד הנמצא בו ארגון הנקרא "כוכבי הניצוץ", המחזיקים ברובוטים ענקיים הנקראים "סייבודי". ניתן להשתמש ולשלוט בסייבודי אך ורק ב-"זמן האפס", מאחר והם נחתמו שם. הארגון מנסה למצוא את ארבעת הכוהנות הנמצאות על האי, על מנת להשמיד את החותם המונע מהסייבודי לצאת מזמן האפס, ולחשוף אותם אל העולם, אך טאקוטו לא ירשה לזה לקרות. בין השלושה נוצר משולש אהבה, במי וואקו תבחר?