Rufy e la sua ciurma sono in estasi davanti alle macchine futuristiche quando l'immagine sputata di Bartholomew Kuma li attacca. Mentre Rufy si prepara ad attaccarlo, Boney reagisce immediatamente, con grande stupore di tutti. Incapace di reprimere ulteriormente le proprie emozioni, la giovane rivela allora l'improbabile legame che la unisce a Kuma.

La potenza scientifica di 900 anni fa viene rivelata dal gigante di ferro. Vegapunk è affascinato dall'energia di un oggetto antico e ricco idee e ideali. Cosa ti aspetta nel futuro che sogni?

La CP-0 guidata da Rob Lucci effettua un atterraggio forzato a Egghead e le persone sulla Fabriophase sono immerse nella confusione mentre Shaka e gli altri si preparano a contrattaccare sulla Labophase. L'infuriato Atlas si alza per difendere la pace dell'isola.

Rufy si trasforma nel Guerriero della Liberazione mentre anche Rob Lucci mostra la sua forma risvegliata del Frutto del Diavolo. Mentre i due si scontrano, Vegapunk rivela la scioccante verità sul frutto Gum-Gum e la sua teoria illuminante sui frutti del diavolo.

Vegapunk descrive come è riuscito a conferire i poteri del Frutto del Diavolo ai Seraphim, cosa che sorprende Franky e gli altri. Nel frattempo, Rufy sta ancora affrontando Lucci nella sua forma selvaggia e risvegliata, ma il razzo per Labophase sta per partire.

Vegapunk chiede alla ciurma di Cappello di Paglia di portarlo a bordo della loro nave, cosa che rende felici Franky e Usopp ma infastidisce Nami. Lucci ordina alle sue truppe di bloccare tutte le vie di fuga di Vegapunk e cerca di invadere Labophase, fortemente protetta.

Kaku cerca di distruggere la Sunny, ma Zoro para l'attacco e i due iniziano a combattere. Nel frattempo, mentre il sistema di sicurezza viene riattivato, Rufy, Chopper e Jinbe si ricongiungono ai loro compagni nel laboratorio. Intanto Vegapunk fugge dall'ira di Bonney che con i suoi poteri infine lo trasforma in un bambino. Vegapunk conferma di non poter fare tornare Orso come prima, ma spiega che è stata una decisione volontaria ed è fiero di essere suo amico. Egli non vuole rivelare le ragioni di Orso poiché ha fatto una promessa, ma Bonney viene attirata da una stanza dove trova una bolla creata con i poteri di Orso. Quest'ultimo ha iniziato nel frattempo a scalare la Linea Rossa, mentre è preso di mira da cannonate dei marine. Intanto, mentre i pirati di Kid raggiungono l'isola di Erbaf, il viceammiraglio Garp arriva alla base G-14 dicendo a Hermeppo che intende recarsi sull'isola Alveare per salvare Kobi.

Vegapunk cerca di dissuadere Bonney da entrare in contatto con la bolla affermando che è un dolore che la ucciderebbe, ma la ragazza, che conosce bene i poteri del padre, capisce che si tratta invece di ricordi. Nel frattempo i Seraphim hanno raggiunto Labophase con la CP0 e Lucci ordina loro di distruggere il laboratorio. Shaka spiega che i Seraphim prendono anche decisioni in autonomia, ma averli lì gli consente di dare un ordine che sovrasta quelli della CP0, facendo loro cambiare schieramento di nuovo. Lilith, Edison, Sanji e Franky corrono a dare man forte ai compagni, ma improvvisamente Stussy, in realtà un clone della scienziata del MADS ed ex piratessa Miss Buckingham Stussy, attacca a tradimento Kaku succhiandogli il sangue come un vampiro e facendogli perdere i sensi. Quando Lucci la attacca, Stussy riesce ad immobilizzarlo con un rossetto fatto in realtà di agalmatolite e mettere anche lui al tappeto allo stesso modo.

Stussy sfodera improvvisamente le sue zanne e stende Lucci! Vedere il suo sorriso inaspettato confonde i Cappello di Paglia! Mentre il feroce assalto dei Seraphim continua, il vero obiettivo della misteriosa Stussy viene rivelato!

In procinto di fuggire da Egghead, il Dr. Vegapunk, figura chiave della missione, scompare improvvisamente e inspiegabilmente. Dove potrebbe essere andato se il laboratorio era chiuso? La ciurma di Cappello di Paglia inizia a cercare il geniale scienziato.

Misteriose interferenze nelle comunicazioni dividono la ciurma di Cappello di Paglia. I Satelliti vengono colti di sorpresa e le loro vite sono in pericolo. Qualcuno è nel Labophase chiuso! Un inevitabile gioco mortale con dubbi e paure travolge Luffy e gli altri!

Egghead viene lasciata indifesa mentre una grande flotta si avvicina! Chi è la persona misteriosa che ha impedito a Luffy e ai suoi amici di scappare e ha eliminato Shaka?! La mente dietro al piano per eliminare Vegapunk viene finalmente allo scoperto!