就读圣米海洛夫学园的织部真冬与山边灯，平常在班上总是遭受欺凌。灯将这样的困惑与悲伤藏进心里并常保笑容，使得真冬坚信自己一定要保护灯。某天，名为沙夏的神祕少年，出现在她们两人的面前。

放学之后，同班同学文奈来到山边家探视。她是少数会关心灯与真冬的朋友，并且察觉到校内正在发生某种状况。此时镁之炼金士伸出魔掌掳走文奈，勇敢挺身面对的真冬，发现了敌人出乎意料的真面目……！

与沙夏共同生活的每一天虽然慌乱却快乐。即使因为沙夏异于常人的言行而伤透脑筋，真冬依然逐渐取回了昔日的笑容。另一方面，美由梨与华迎接了另一位留学生卡洽。卡洽宛如妖精的容貌，使华的内心小鹿乱撞……

华被卡洽抓到把柄了。即使她拼命要否定自己的本性，却无法抗拒卡洽的诱惑……!?另一方面，真冬等人前往市区购物，沙夏与泰蕾莎也为了保护灯而同行。众人开心购物并来到内衣专柜试穿，然而灯与泰蕾莎却忽然失踪！

泰蕾莎．贝莉亚。虽然经常以圣女的身分陪伴沙夏，她的日常生活与身世却无人知晓。异端鍊金士组织“秘仪”派遣了毒气密室狂——操纵氯的净化者克罗亚前来。沙夏等人受命要除掉他，但泰蕾莎面对宿敌时却无所适从。

为了寻找传说中的圣像“瑟鲁依．苏之圣女”，真冬在辻堂家举办的俄罗斯秘宝展担任展场女郎，美由梨则是因为灯与沙夏也对她唯命是从而开心不已。在这个时候，武装部队为了抢夺梦幻美术品“皇女之卵”而展开袭击！

真冬和美由梨一起来到山边的别墅，寻找“瑟鲁依．苏之圣女”的线索。即使对于开心享受列车之旅的美由梨感到无言以对，真冬依然紧张无比，因为她非得要努力保护灯才行。然而在前往别墅的途中，两人受到秘仪术士的袭击而失散。

凤来到圣米海洛夫学园担任临时讲师。意外与恩人重逢，使得真冬无法掩饰自己的喜悦，为凤以及一同转学前来的利兹举办一场欢迎会，然而沙夏却不知为何很不高兴。罗宋汤VS牛肉炖汤的结果是？另一方面，敌方的新炼金士出现在华的面前……

秘仪的氧气术士朽叶悠，对于操纵铁或铜的金属术士来说是最强的天敌。他的妹妹朽叶葵来到山边家向沙夏求助，看到葵与沙夏之间的不寻常气氛，使得真冬有些吃味。葵对真冬与灯述说自己的状况，然而在这个时候，她的身体却出现异状…!?

史伽在学校旁边遭遇了色狼，对方喊着“露出你的奶！”并展开袭击。真冬等人进行夜间巡逻维护治安，却遇见拥有强大炼金士能力的某人。另一方面，留守的灯挑战做饭，然而锅子却冒烟喷出火，门外还闯进一个诡异的男性…!?

面对华与美由梨等人的挑衅行为，真冬一个人挺身面对，在局势一触即发的状况下，出面解围的人是沙夏。暗恋并崇拜沙夏的史伽，某天遇见自称“Q”与“R”的双胞胎少女。宛如娃娃般可爱的她们，居然主动服侍起史伽…!?

目睹沙夏与秘仪的水银术士夏娃．希尔瓦的战斗，班上同学无法掩饰内心对沙夏的疑惑。然而在史伽提出勇气表达意见之後，沙夏马上受到众人的欢迎，真冬与灯也松了口气露出笑容。学校看似恢复为往日的和平，然而…？

真冬与其他的女性成员们，来到了深山里的一座温泉旅馆。今天预定要好好休息一整天，度过悠闲愉快甜甜蜜蜜的时光。参加旅行的包括真冬、灯、泰蕾莎、卡洽、史伽、带队的丽老师，与另外一个人…此外连“地狱摸乳师”也登场了，沙夏究竟发生了什么事…!!?

受到自己强大的力量与战斗的命运捉弄而苦恼的英雄，在这座城市诞生了。她的名字叫做百合假面。竞争对手伟大百合假面的登场，卡洽老师充满血泪与液体的修行，以及崇拜百合假面而志愿成为英雄的沙夏。百合假面究竟是救世主，还是普通的变态!?

在上一场战斗受到重伤的沙夏，依然没有从后遗症恢复。自己究竟是谁，背负着什么任务——在恶梦的折磨之下，他离开了山边家。另一方面，莉兹烦恼于自己被凤当成孩子看待，这样的两人在街上相遇，并且——在角色扮演女仆的邀请之下，走上大人的阶梯…!?

由于得到灯与彩蛋，凤即将获得瑟鲁依．苏之圣女。一心报仇的沙夏，却接到待命的命令，因为凤是秘仪最凶狠的杀戮者，通称“断罪的不死鸟”，上级判断沙夏没有胜算。然而即使如此，沙夏依然执意前去找凤，结果真冬挡住了他的去路……

沉眠于皇女之卵的“剑之圣女”，是力量足以消灭最强炼金士的上古回路。黄金的炼金士终于复活了，获得灯的身体使得他满心欢喜，并且以这具身体逗弄真冬。另一方面，被复仇之火焚身的沙夏，手中的镰刀终于撕裂泰蕾莎的身体…!?

圣米海洛夫学园来了两名转学生，藤臣弼与仙道六实。六实是沙夏的第一个圣女，她的强硬作风令沙夏不敢领教，内心动摇的模样令真冬醋意大发。就在学校看似恢复以往热闹与和平时，学生会长弓枝却遭受墙里伸出的神秘魔手袭击…!?

剑之圣女，这个上古回路存在于真冬身上。另一方面，被愚者掳走的灯，在秘仪的根据地清醒了。她水准过人的圣乳，使得秘仪的鍊金士感到讶异，其中的一名炼金士吉达，明显对灯展露不悦的神情。在灯孤单受到囚禁的时候，一名少女闯入她的房间……

真冬他们开始调查凤留下的研究资料，沙夏则是前去拜访某人。在这个时候的辻堂家宅邸，为卡洽举办了生日派对。收到纸制皇冠这个礼物的卡洽虽然有些失望，但看到同学们的天真笑容也自然释怀。众人享受开心时光的这时候，忽然有一只野生动物前来闹场……！？

沙夏与真冬前往学园的湖泊进行调查。真冬受到恶梦的折磨，侵蚀内心的那个声音令她痛苦不已。另一方面，腓特烈．多拿率领的封建君主王朝，于此时正式展开行动了。与他们联手的秘仪炼金士们也逐渐集结，接着多拿的魔掌终于伸向真冬…！

随着水之圣堂的出现，体内蕴藏著剑之圣女的真冬，身体忽然产生了变化。从全世界女性吸收微量圣乳而成的究极圣乳，令炼金士们欢欣不已。多拿等人即将得到瑟鲁依．苏之圣女了，虽然沙夏动身追赶，秘仪的炼金士们却接连挡住去路！

“一同成为神吧”。黄金之炼金士邀请沙夏成为同伴，但沙夏情绪激动到极限使得力量失控，看起来简直像是怪物，连真冬与卡洽都无法平息他的怒火。即使如此，黄金之炼金士的实力依然在沙夏之上，为这场战斗决定命运的关键将是…!?