Rin quer fazer amizade com Godainn, um garoto que parece estar conseguindo ver demônios. Para isso, ele busca alguma forma de fazer com que ele pare de vê-los. Para isso, Mephisto propõe a ele e seus amigos um teste.

Yukio é chamado para uma reunião no Vaticano. Após isso, Rin e seus amigos são chamados para encarar outro desafio em mais uma aula extracurricular. Mas dessa vez Kamiki e Izumo devem trabalhar sozinhas.

Se aproxima o festival da Academia Vera Cruz. Rin e companhia estão muito empolgados com a festa de dança, mas eles precisam de um par do sexo oposto para participar. No entanto, tudo começa a complicar quando todas as meninas começam a recusar os convites...

Izumo de repente é atacada durante o festival e de repente Rin e seus amigos se veem tentando ao máximo ajudá-la. Mas quem será o verdadeiro inimigo em meio a tudo isso?

Depois do incidente na Academia de Vera Cruz, Rin e companhia partem para Inari Taisha para tentar descobrir mais sobre os Illuminati e para tentar salvar Izumo Kamiki, que foi sequestrada por eles.

Izumo Kamiki é filha de Tamamo, Sacerdotisa Chefe e herdeira da família Kamiki, os usuários da Pedra Assassina, capazes de controlar a Nove Caudas. Izumo era uma garota quase normal, até que um dia sua mãe começa a mudar de comportamento. Em meio a isso, Izumo é visitada por um grupo de pessoas que se designa como os "Illuminati".

Enquanto Izumo tenta fugir, o grupo de Rin e Yukio invade a Cidade da Paz Inari. Mas o que será que os espera em território inimigo?

Gedoin se encontra com Lúcifer e recebe orientações de como prosseguir para conter a invasão de Rin e companhia. No entanto, logo em seguida ele recebe uma notícia ruim com relação a Izumi. Enquanto isso, Rin e seus amigos tentam sair das prisões que foram colocados.

Gedoin se revela para Rin e seus amigos, mostrando o terror dos seus experimentos. Em meio a isso, Rin parte para tentar salvar seus amigos, enquanto começa o experimento para colocar a Nove Caudas na Izumo.

Rin e seus amigos conseguem chegar até Izumo, mas ela está possuída pela Nove Caudas, enquanto Gedoin prepara um novo ataque. Será que vão conseguir resgatá-la?

Depois da batalha contra os Illuminati, Rin e seus amigos descobrem a verdade sobre Shima, o que os faz questionar as atitudes que tiveram com relação a ele até o momento.