Napędzani zemstą i wściekłością, nowo zjednoczeni rodzeństwo Savage Opress i Darth Maul sieją terror i przemoc w całej galaktyce. Gdy bracia Sithowie siłą rekrutują Hondo Ohnakę i jego piratów, Obi-Wan Kenobi i Adi Gallia ścigają ich, co prowadzi do śmiertelnej konfrontacji.

Anakin, Obi-Wan, Ahsoka i Rex podróżują do Onderonu, świata kontrolowanego przez Separatystów. Tam będą szkolić grupę rebeliantów - w tym Lux Bonteri - do pomocy w odbiciu stolicy Iziz spod rządów dwulicowego króla.

Pod nadzorem Ahsoki rebelianci Onderonu infiltrują stolicę i przeprowadzają serię ataków na cele w całym mieście. Gdy król z sojuszem Separatystów znajduje się pod rosnącą presją, by uporać się z rosnącym buntem, rebelianci wybierają nowego przywódcę.

Po buntowniczej próbie uratowania prawdziwego króla Onderona, Ramsisa Dendupa, nieoczekiwany sojusznik występuje, aby powstrzymać egzekucję Dendupa i wesprzeć sprawę rebeliantów.

Gdy rewolta na pełną skalę wciąga Onderona, rebelianci zadają decydujący cios królowi planety, zorientowanemu na separatystów. Niestety dla rebeliantów takie zwycięstwo ma wysoką cenę.

Gdy młodzi wracają z Ilum z Ahsoką, ich statek zostaje zaatakowany przez gang piratów Hondo. Dzieci muszą używać pomysłowych i improwizowanych pułapek, aby udaremnić rozbójników.

Gdy Ahsoka zostaje schwytana przez piratów Hondo, młodzi współpracują, aby zinfiltrować jaskinię piratów, używając sprytu i odwagi, by oszukać Hondo Ohnakę i rozpocząć śmiałą akcję ratunkową.

Kiedy generał Grievous przypuszcza atak na pełną skalę na piracką bazę na Florrum, Ahsoka i młodzi ludzie walczą ramię w ramię z Hondo i jego piratami, aby odwrócić siły Separatystów.

R2-D2 jest częścią zespołu droidów Republiki wybranych do ważnej misji prowadzonej przez drobnego pułkownika Gascona w celu uzyskania modułu szyfrującego z pancernika Separatystów. Droidy muszą pokonać wiele trudnych przeszkód, aby odnieść sukces w tym kluczowym zadaniu.

Po tym, jak kometa uszkodzi ich wahadłowiec, R2-D2, pułkownik Gascon i inne droidy rozbijają się na odludnej planecie, gdzie muszą przedostać się przez oszałamiającą przestrzeń pustki, aby wykonać swoją misję.

W prawie pustym mieście R2-D2 i jego zespół znajdują komandosa-klona cierpiącego na amnezję.

R2-D2 i jego zespół muszą powstrzymać sabotowany krążownik Jedi przed zniszczeniem kluczowej konferencji Republiki.

Savage i Maul zawierają sojusz z Death Watch, aby zaatakować wspólnego wroga: Obi-Wana Kenobiego.

Wspierani przez przestępcze półświatki, Sith i Death Watch przypuszczają atak na Mandalore.

Używając Księżnej Satine jako przynęty, Darth Maul zwabia Obi-Wana w pułapkę.

Anakin i Ahsoka badają śmiertelny zamach bombowy w Świątyni Jedi.

Gdy wojsko Republiki przejmuje sprawę zamachu w świątyni, Ahsoka staje w sprzeczności z admirałem Tarkinem.

Zbieg Ahsoka ucieka w przestępcze głębiny Coruscant.

Przed sądem za morderstwo Ahsoka staje przed największym wyzwaniem.