Не столь далёкое будущее. В водах Мирового океана появляется террористическая организация, известная как USR. Главарём всей этой морской "банды" выступает Адмирал Ред, как и все остальные подобные злодеи, жаждущий достижения своих амбициозных целей. Для того чтобы противостоять появившейся угрозе, было принято решение о создании Организации Объединённого Флота PKN. Во время церемонии представления всех судов PKN, кроме подводной лодки 707, которая ввиду своей малой скорости просто опаздывала, на них открыто и бесцеремонно нападает Адмирал Ред. Через год 707-ю восстанавливают и спасшаяся команда предыдущей подлодки во главе с их капитаном Хаями вновь выходит в море чтобы присоединиться к основному флоту во главе с новейшей американской подлодкой Great Guardian. Подлодка 707 подходит в нужную точку лишь к концу боя и теперь его исход и дальнейшие действия флотов будут зависеть только от неё, ведь Адмирал Ред считает Хаями, капитана подлодки 707 единственным достойным противником...