A forma de vida alienígena Falange, que pode assumir qualquer forma, ataca a Terra e captura todos os X-Men, com exceção do Fera. O Dr. MacCoy terá que salvar seus amigos e arrumar uma forma de deter a criatura.

Salvos da Falange pelo Sr. Sinistro, Fera e Forge reúnem aliados para derrotar o alien. Além do próprio Sinistro, os X-Men ainda ganham como aliado Magneto. Juntos tentam liquidar a criatura para salvar o planeta.

Omega Red está de volta. A máquina assassina pretende destruir um submarino nuclear próximo a costa do Havaí caso Wolverine e Tempestade não forem ao seu encontro. Mas, isso era só fachada Omega Red tinha outros planos para o arsenal nuclear do submarino."

Cyclope, ainda de luto após a "morte" de Jean Grey, sai dos X-Men, retorna para o orfanato que foi criado e reencontra sua amiga Sarah. Ela lhe diz que um homem rico decidiu adotar todas as crianças mutantes, especialmente Rusty, mas ele tem a intenção de torná-las seu exército para destruir todos os seres humanos para que os mutantes sejam aceitos. Cabe a Cyclope pará-lo e salvar as crianças mutantes. Mais tarde, Cyclope retorna à mansão e ele e os outros X-Men descobrem que Jean Grey não morreu afinal.

Longshot aparece na Terra sem memória, junto com uma gangue de assassinos que inclui Espiral. Na verdade ele estava fugindo de Mojo, aquela criatura interdimensional que possui um estranho show de TV. Ao final das contas, resta aos X-Men e Longshot participarem mais uma vez do gameshow mortal.

Noturno fica sabendo que sua mãe, que até então ele próprio desconhecia, estava correndo perigo, e pede ajuda aos X-Men. No meio dos acontecimentos, o herói descobre que possui mais parentes do que podia imaginar.

O alien Arkon começa controlar o tempo em Washington, chamando a atenção de Tempestade. Na verdade, ele queria levar a mutante para seu planeta Corsus para resolver um situação de caos meteorológico. Quando Tempestade resolve a situação, ela é pedida em casamento por Arkon.

Antes do casamento, Tempestade fica sabendo sobre a forma em que os serventes do palácio eram mal tratados. Os X-Men, que foram ao planeta resgatar sua companheira, descobrem que havia muitos escravos trazidos de outros planetas para trabalharem em Corsus. Agora, Tempestade terá que decidir se vai ou não se casar com o tirano.

Jubileu leva um grupo de crianças para passear numa caverna perto da mansão X. Mas o grupo fica preso dentro do lugar. Enquanto espera pelo resgate dos X-Men, Jubileu diverte as crianças contando sobre contos medievais repletos de princesas, dragões e mutantes.

Fabian Cortez sequestra Jubileu para usá-la como oferenda ao renascimento do Apocalipse. Fera é o único que pode ajudá-la.

Em Paris, Wolverine visita um cemitério onde descansam soldados com quem lutou durante a Segunda Guerra Mundial e relembra de suas missões na capital francesa ao lado do Capitão América, na qual tinha que resgatar um cientista que estava refém do Caveira Vermelha.

Em Londres, dois cientistas debatem a teoria sobre a seleção natural. Em meio a discussão, um deles descobre sobre o gene mutante e como usá-lo para salvar uma grande paixão. A descoberta se torna uma obsessão que o leva a experimentos bizarros. Em meio a essa desordem, um grande inimigo surge.

O filho de um mineiro, o mutante Míssil, expõe seu poder mutante a fim de resgatar seu pai e um amigo de um desastre. Após ser considerado herói, ele acaba por ser discriminado graças a rumores criados por aqueles que o querem ao seu lado. Vampira sente o problema e o ajuda a escolher o caminho certo.

O Professor Xavier é atacado durante um congresso no qual explanava sobre como lidar com os mutantes e acaba por entrar em coma. Em meio a esse ataque, Magneto vê uma oportunidade de juntar unir diversos mutantes mais uma vez contra os humanos comuns. Mas o que fazer quando se é o único que pode salvar um grande amigo?