ミシガン通りで重要証人を乗せていた救急車が突然、爆発炎上する。偶然通りかかったアビーも爆風で吹き飛ばされるが幸い軽傷で済み、現場の救急活動に協力。そして救急車に乗っていたのはプラットと判明するも、プラットも軽傷とわかる。しかし、ひと安心していた矢先に……。

市内のアパートで爆発事故が発生、爆発した部屋の隣に住む若い男女が急患として運ばれてきた。もう1人運び込まれた重症の男も爆発の被害者のようだが、なぜか頑なに治療を拒む。一方、新任ER部長としてキャサリン・バンフィールドという女性が現れ、ルールや効率を優先する冷徹な態度にモリスたちは反発心を抱く。

塀の上から転落したという少女ジュリーが母親と妹に付き添われて搬送される。ゲイツたちが治療に当たるが、その間に、呼吸器のレベルが下がったり、ジュリーに掛けられたシーツが燃えたりと、奇妙な出来事が次々と起こる。やがてジュリーの口から転落の真実が語られるのだが……。

相変わらず目の回るような忙しさのERだが、今日はハロウィーンのため様々な急患が押し寄せていた。飲み過ぎや食あたり、パーティー騒動の被害者など多種多様な患者が運ばれる中、学校のケンカ騒ぎで鼻を殴られた少年と胸にフォークを刺された高校生が運ばれてくる。どうやらこの2人がケンカをしたらしい。

プラットの弟、チャズが医学生1年の研修にやってきた。親友プラットが亡くなったショックからまだ立ち直れないモリスは、チャズにプラットを重ね合わせてチャズをえこひいきしてしまい、インターンたちからは不満の声が上がる。そんな時、ボクシングでKOされ怪我を負った患者が運ばれてくる。

新任部長のバンフィールドが湖畔をジョギングしていると、ベビーカーの赤ちゃんが溺れている事故に遭遇する。赤ちゃんは直ちに搬送され、スタッフ一同懸命に治療を続けるが、身体は冷えきって危険な容体が続く。そんな中、治療に当たったバンフィールドは、6年前の悲劇を思い出していた。

放火と思われる火事で負傷した女性が運ばれてくる。救出したのは夫のヘンリー。話によれば、ヘンリーは小学校の音楽教師をしていたのだが、生徒にセクハラで訴えられており、判決は無罪だったものの隣人たちから犯人扱いされ嫌がらせを受けていたという。これを聞いたサイモンの表情が急変する……。

シカゴは大雪に見舞われ、オマハで緊急医療学会に出席していたバンフィールドとモリスは現地で足止めを食らっていた。この日ばかりは患者が少ないERだったが、やがて交通事故に遭った若い男女が搬送される。患者を見たサムは、そのうち1人が息子アレックスであることを知って愕然とするのだった。

クリスマスを迎えたERは今日も変わらずの大忙し。そこへ妊婦のグロリアが運ばれてくる。移民帰化局の強制捜査が入った時に転倒、陣痛が始まったという。不法入国者である彼女は、捕まれば国外追放は免れないが、まずは無事に出産させようと奮闘するニーラたち。しかし、お腹の子供に腫瘍が見つかり……。

麻薬売買のトラブルから銃撃戦が起き、4人の銃創患者が運ばれてくる。1人はまもなく死亡、2人は兄弟で、兄が17歳、弟はまだ幼い子供だった。もう1人はセリーナ・ディアズという女で、診療しようにも手がつけられないほどの暴れっぷりに、モリスたちも困り果てるが、やがてモリスは彼女の秘密を知ることとなり……。

夜勤明けのニーラは疲れ果てているが帰れない。そんな中、“ドリームランナー”という男が運ばれてくる。夢遊病のような症状で、2階から飛び降りて怪我をしたようだった。先週から入院している少女アナスタシアの容態も優れない。彼女の手術をめぐってドゥベンコと言い争いとなり、その間にも少女の具合は悪くなり……。

風呂場で転倒したという年配の女性が、過去3度も彼女と結婚と離婚を繰り返してきた相手ハリーに付き添われ運び込まれてくる。治療を受けていた彼女が急変して死の淵に立たされた時、ハリーが再び求婚をして彼女が受け入れる。そんな2人の関係を見て、サムは複雑な思いに駆られる。

カウンティーに認知症の老人が現れる。強盗に遭ったらしく、所持品は奪われていて身元が分からない。やがてかつてのER部長、モーゲンスタンが駆け付け、この老人の健康管理を任されているのだと話す。一方、長年連絡が途絶えていたサムの妹ケリーが突然現れる。

カウンティーの救急車入口に、乗用車が猛スピードで突っ込んでくる。幸い娘のルーシーは軽傷だったが、母親のジョアニーは骨盤に重傷を負っていた。さらに、ジョアニーの心臓に欠陥が見つかり、長期入院の必要があると分かる。その間、ルーシーをジョアニーの弟、スチュアートに預けることになるのだが……。

街のクラブで客同士のトラブルがあり、怪我をした2人の男が運ばれてくる。うち1人は顔面を殴打されて重傷を負っていた。連れてきたのは警察官のクローディアと上司のマロリー。しかし、マロリーの説明と怪我の状態が合致しないため、モリスは不審に思いクローディアを問い詰める……。

久しぶりにカウンティーに復帰したカーター。その実力は大きな戦力となるが、一方でカーターの医療方法は時折古臭く思われることも。そこに、爆発事故で負傷した患者が運ばれてくる。治療法をめぐり、対立するカーターとニーラたち。カーターは反対を振り切り自分の治療法を貫くが……。

自分の過去について話したがらないサイモンに不信感を抱くニーラ。モリスの恋人クローディアが捜査中に撃たれて搬送されてくる。クローディアの容体は思ったよりも重く、危険な状態に陥るが、懸命の治療により一命を取り留める。しかし、治療中にカーターが倒れてしまう。

シアトルのメディカルセンターへ移植用の心臓を受け取りに行くニーラとサム。その臓器移植の担当は偶然にもロスとキャロルだった。ロスたちは交通事故で死亡した孫の臓器提供に抵抗を見せる祖母の説得に当たる。その頃、シカゴのノースウェスタン病院では、カーターに腎臓移植の順番が来たことが告げられる。

ニーラのカウンティーでの勤務、最後の日。ショッピングセンターにバイクで突っ込んだ女性が運ばれてくる。診察の結果手術が必要と判断されて、これがニーラの2500番目の記念すべき症例になりそうだった。やがて、同僚たちに別れを告げ、空港へと向かうニーラだったが……。

心臓手術を受けた子供たちを対象にしたプログラムで、体育館に集まって、ゲームなどを楽しみ、夜はテントを張って、一晩を過ごすという、キャンプ・デル・コラソンにボランティアとしてクローディアと一緒に参加するモリス。一方ニーラが去って気落ちしていたサイモンに、更に悲しいニュースが届く。

ジョシュア・カーター・センターのオープニング式典が行われ、かつてのカーターの恩師や同僚たちが駆け付ける。久しぶりの再会を祝う一同。カーターの妻ケムもパリからやって来るが......。そんな中、学科試験をパスした医学生たちが、面接を受けるためにカウンティーを訪ねて来る。